Помимо супруги Стюарта ведущую роль при Сен-Жерменском дворе играли члены нового правительства, созданного Яковом II в эмиграции[1729]. Прибыв в Сен-Жермен летом 1690 г. после поражения на р. Бойн, изгнанный монарх обнаружил структуру двора и придворные должности «в весьма неупорядоченном состоянии»[1730]. Это было вызвано, с одной стороны тем, что в конце 1688 — первой половине 1690 г. эмиграция казалась лишь временной, и придворные были готовы к тому, что в любой момент может появиться сигнал о возвращении на родину, с другой — тем, что Яков II в 1689 г. учредил собственный двор в Дублине и большая часть наиболее знатных британских аристократов отправилась с королем в Ирландию[1731]. Поэтому, вернувшись в 1690 г. во Францию, Яков II первым делом провел внутреннюю реформу своего двора. Прежде всего, он официально утвердил всех придворных чинов и членов Тайного совета в их должностях. Вслед за тем был учрежден особый тайный кабинет, в котором Яков II обсуждал все вопросы в узком кругу. В состав кабинета вошли граф Мелфорт, бывший генеральный прокурор Ирландии Ричард Нэйгл, личный секретарь Марии Моденской Джон Кэрилл, ректор Шотландской коллегии в Париже Льюис Иннес, бывший британский посол в Испании Джон Стаффорд и якобитский агент Генри Браун[1732]. Г. Браун был назначен ответственным за деятельность якобитов в Англии, Л. Иннес — в Шотландии, Р. Нэйгл — в Ирландии. Герцог Поуис получил должности лорда-казначея и управляющего двором короля[1733].
Кроме официальных чинов значительную роль при Сен-Жерменском дворе играли предводители восстаний якобитов в Ирландии и Шотландии 1689–1691 гг. Поскольку одной из главных задач якобитов, бежавших с родины, стало получение пенсий или оплачиваемых должностей при якобитском дворе или во французской армии, в среде эмиграции интенсивно развивалась система патроната. Интересы англичан при Сен-Жерменском дворе представлял герцог Берик, шотландцев — граф Перт, ирландцев — граф Лакэн[1734]. Одно время при Сен-Жерменском дворе находился герцог Гордон, который, однако, получив холодный прием у Якова II, вскоре вернулся в Шотландию, где был временно заключен под стражу. Гордоны, распыленные по всей Европе, чрезвычайно беспокоились о судьбе своего вождя[1735].
Среди ближайшего окружения Якова II в эмиграции развернулась борьба за первенство и влияние на низложенного монарха. В первые годы пребывания Стюарта во Франции его главным фаворитом был граф Мелфорт. После «Славной революции» в карьере графа наступил новый этап. В 1689 г. он был назначен Яковом II государственным секретарем. Таким образом, шотландский аристократ, возглавив британское правительство в эмиграции, поднялся на высшую ступень при Сен-Жерменском дворе[1736]. Людовик XIV и его окружение первоначально одобрили это назначение, считая Мелфорта наиболее компетентным политиком из тех, кто последовал за британским монархом в изгнание[1737]. Однако конфликт с французским послом в Ирландии — могущественным графом д'Аво — привел к падению Мелфорта. Осенью 1689 г., воспользовавшись отсутствием во Франции его патрона — Якова II, Людовик XIV отправил вернувшегося из Ирландии шотландского аристократа фактически в ссылку: под предлогом выборов нового понтифика Мелфорт был назначен послом Якова II в Риме[1738]. Находясь при папском дворе, опальный граф продолжал интенсивную переписку с Яковом II[1739]. Используя связи при Сен-Жерменском дворе, в частности, личное влияние на королеву Марию Моденскую, Мелфорту удалось через полтора года добиться отставки со своего дипломатического поста и вернуться во Францию, где он был восстановлен Яковом II в должности государственного секретаря[1740]. 17 апреля 1692 г. Мелфорт был награжден герцогским титулом и, таким образом, занял высшую ступень в среде британской титулованной знати[1741]. В начале 1690-х гг. Мелфорт организовал и возглавил тайную агентурную сеть, которая действовала на территории Британских островов[1742].