В духовных учебных заведениях, в зависимости от уровня реализуемых образовательных программ, стали защищаться бакалаврские работы, магистерские и кандидатские диссертации.
Заседание Высшего Церковного Совета. 17 февраля 2017 г.
Магистратура как уровень образования в духовных школах появилась в 2010 году. Являясь вторым уровнем высшего образования, магистратура готовит кадры для научно-исследовательской, преподавательской и церковно-административной деятельности, удовлетворяет кадровую потребность Церкви в высококвалифицированных специалистах. Наибольшее количество магистрантов обучается по традиционным для отечественных духовных школ направлениям: историческому, богословскому, церковно-практическому и библейскому. Откликаясь на требования времени, семинарии открывают профили различных направленностей.
Кандидатские диссертации защищаются в тех учебных заведениях, где имеется аспирантура и функционируют кандидатские диссертационные советы. На сегодняшний день таковые имеются только в духовных академиях и при Общецерковной аспирантуре.
Защита докторских диссертаций происходит в утвержденном в 2011 году решением Святейшего Патриарха Общецерковном докторском диссертационном совете, который является общим для всех научно-академических учреждений Русской Православной Церкви.
В числе прочих направлений, касающихся реформирования церковного образования, можно выделить формирование системы дистанционного образования, оптимизацию подготовки регентов, курсы повышения квалификации для духовенства и преподавателей Основ религиозной культуры и светской этики в школах.
17 февраля 2017 года на заседании Высшего Церковного Совета был представлен проект создания системы дистанционного образования, позволяющий семинариям перевести заочный сектор на заочно-дистанционное обучение с принципиально новыми современными решениями относительно традиционных схем обучения на заочном секторе.
В марте 2016 года было принято решение о формировании рабочей группы по созданию церковных стандартов высшего и среднего профессионального духовного образования регентов. Рабочая группа, взяв за основу опыт и предложения Регентского отделения Санкт-Петербургской духовной академии, разработала пакет документов, необходимых для перехода на стандарт, позволяющий регентским школам получать государственную лицензию, а в перспективе — аккредитацию. Представленный пакет документов принял Высший Церковный Совет, внеся в него необходимые поправки, и передал его на утверждение Священного Синода. Священный Синод утвердил как образовательную программу подготовки служителей Русской Православной Церкви по специальности «Регент церковного хора, преподаватель», так и все сопутствующие документы[573].