8 декабря 1986 года в тюрьме из-за четырехмесячной голодовки с требованием освободить политзаключенных умер известный правозащитник Анатолий Марченко. Его смерть получила широкий резонанс не только в диссидентской среде СССР, но и в зарубежной прессе, что подтолкнуло власти к решительным действиям. Через десять дней после смерти Марченко академику Сахарову, находившемуся в ссылке в городе Горьком, установили в квартире телефон, и в тот же день ему позвонил Горбачев. Горбачев сообщил о том, что решением правительства Сахарову разрешено вернуться в Москву и продолжать научную работу. Сахаров, со своей стороны, задал Горбачеву вопрос о судьбе политзаключенных в СССР, об освобождении которых он ранее просил руководство страны. Горбачев ответил, что вопрос рассматривается и что часть заключенных уже на свободе.

В 1987 году была объявлена амнистия, которая коснулась осужденных диссидентов и тех, кто был заключен или сослан за религиозную деятельность. В том же году был амнистирован и восстановлен Московской патриархией в священническом служении Глеб Якунин. Сандр Рига был также освобожден и вернулся в Москву.

Борьба с религией перестала считаться актуальной, и на этом фоне началось взаимодействие чиновников с религиозными лидерами. Благодаря проводимой политике открытости стали укрепляться связи с иностранными государствами, которые настаивали на том, чтобы власть отказалась от атеистической пропаганды.

С этого времени начался значительный рост числа приходов в стране. Оптина пустынь и древний Толгский женский монастырь решением правительства были переданы Церкви. В центральных газетах стали появляться статьи, в которых утверждалось, что Православной церкви отводится главенствующая роль в духовном возрождении страны.

В 1986 году отец Александр впервые официально через Московскую патриархию отправил за рубеж написанные им тезисы доклада об апостоле Павле для Лувенского университета в Бельгии.

В декабре того же года он написал письмо митрополиту Ювеналию. Отец Александр сообщал о том, что два года назад начал работать над «Словарем по библиологии», который хотел бы предложить в качестве юбилейного дара Московской Духовной академии к празднику тысячелетия Крещения Руси. «Разумеется, мне хотелось бы показать Вам свою работу, — писал отец Александр, — но откладывал это до ее завершения. Однако, ознакомившись с прекрасным 27-ым сборником Богословских трудов, где предложено присылать свои замечания к Богословскому словарю, я решил написать Вам сейчас. Быть может, что-то из моего справочника окажется полезным для Издательского Отдела. Словарь состоит из 7 томов, по 300 страниц машинописи каждый. В настоящее время я дописываю 6-ой том. Три передано Владыке Ректору; на днях собираюсь передать 4-ый. Весь Словарь включает свыше 2000 статей и около 400 портретов и фотографий…»