Незадолго до кончины было отцу Даниилу видение. «Подносят мне чашу с водой, — рассказал он, — и я вижу в чаше образ смерти. Я делаю крестное знамение — изобразился тот же образ смерти. Я думаю, что знамение это мне от Бога о близкой моей кончине». Почти перед самой кончиной он сказал своей сестре монахине Архелае: «Сестра, я ухожу в Оптину, а ты иди в Шамордино». Он уходил к оптинцам, насельникам неба…

25 июля 1953 года старец Даниил блаженно почил. Это произошло в 8 часов 10 минут вечера. «После всех перенесенных страданий, — писал очевидец, — он скончался тихо, словно уснул. Ни одного стона не вырвалось из наболевшей груди, не вздрогнул, не потянулся… Такова была кончина праведника!» Тело старца было приготовлено к погребению и положено в гроб. Вокруг теснилось множество его духовных чад. Все плакали безутешно… Прибыли певчие, священник начал служить панихиду. Потом служилась в доме заупокойная утреня. Затем гроб понесли в храм. Народу все прибывало. 27 июля отслужена была заупокойная литургия. Потом отпевание — долгое, по монашескому чину649. Затем похоронная процессия направилась по дороге во 2-ю Михайловку, где пожелал быть похороненным отец Даниил.

Иеромонах Даниил (младший) вспоминал: «Я с несколькими чкаловскими певчими вышел к мосту, перекинутому через речку Самарку… Процессия была торжественная. Впереди на дрогах везли гроб. По сторонам его шли два семинариста, сосредоточенные и печальные, напомнившие мне пламенеющих херувимов. За гробом шла многочисленная толпа с пением Трисвятого». Пройти надо было 18 километров. Люди шли, «среди них были лица и преклонного возраста. Я мысленно обратился к Господу, прося Его укрепить их силы… Дорога на протяжении нескольких километров пути была песчаная, это обстоятельство вдвойне усиливало трудность пути. Приблизительно через час мы добрались до Ивановки. Там уже с утра почти все село ожидало своего любимого отца… Все это духовные чада отца Даниила… Перед гробом бежали дети с цветами и зелеными ветвями в руках… От Ивановки дорога шла окольными путями, поворачивала несколько раз, пришлось идти лесом и переходить через речку. Так мы дошли до Михайловки. Верующие срывали на пути траву и ветки и устилали ими дорогу. При самом входе в село Михайловку нас встретила коленопреклоненная толпа людей со слезами на глазах… Пришлось подниматься в гору, так как кладбище лежит на возвышенности. Вот и могилка». Гроб был опущен в могилу. После панихиды народ долго не расходился. А потом духовные чада покойного приходили на могилку помолиться, взять песочек, попросить старца о помощи… Многие и получали по вере своей просимое. Так закончил свой путь на земле один из старцев Оптинского рассеяния.