Григорий освободился от власти своего врага. Тем не менее он не чувствовал себя в безопасности в Риме. Споры, которые возникли между римлянами и норманами, послужили предлогом к разграблению города и ужасающим притеснениям жителей. С последними обходились так жестоко, что они были очень недовольны приглашением таких свирепых союзников. Григорий покинул Рим и провел остаток жизни в Монте-Кассино и в Салерно. В Риме водворился антипапа. Григорий скончался 25 мая 1085 г. Умирая, он сказал: «Dilexi iustitiam et odi iniquitatem propterea morior in exilio». До последнего часа он был уверен, что боролся за правое дело. Он был похоронен в Салернском соборе.

Раскол тянулся еще довольно долго после смерти Григория VII. Трудность найти ему преемника показала, как тяжело было положение. После перерыва в одиннадцать месяцев аббат из Монте-Кассино, Дезидерий, был возведен на апостольскую кафедру под именем Виктора III (1086–1087 гг.). После его смерти через шесть месяцев состоялось избрание в папы кардинала и епископа Остии Оттона, принявшего имя Урбана II (1088–1099 гг.). Отношения между этим папой и императором были так же натянуты, как и при Григории. Меньше чем когда-нибудь теперь можно было думать об успокоении, так как кроме запрещения мирской инвеституры ныне духовным было запрещено давать ленную присягу государям (соб. Мельфийский 1089 г., к. 11, Клермонтский 1095 г., к. 17). Наследник Рудольфа, Герман Люксембургский, отказался от короны как раз во время восшествия на папский трон Урбана II. Избрания нового короля не последовало. Тем не менее, его партия продолжала бороться. Со своей стороны Генрих IV крепко стоял за свое дело, хотя ему до сих пор и не удалось одержать верха над своими врагами. Вторичный поход его в Италию оказался без успеха, так как графиня Матильда Тосканская, несмотря на семилетнюю войну, не подчинилась. К этому надо присовокупить неблагополучное положение вещей в Англии. Вильгельм II (1087–1100 гг.), сын Завоевателя, твердо держался, как и его отец, своего права назначать и жаловать лены духовным лицам. Он постыдно продавал духовные должности и захватывал церковные имущества. После кратковременного раскаяния король изгнал святого Ансельма, епископа Кентерберийского. Последний стал искать защиты у папы (1098 г.).

Первое улучшение дела последовало при Пасхалии I (1099–1118). Дело в том, что со смертью Климента III прекратился раскол (1100 г.). Два первых антипапы, выбранные сторонниками Виберта, подчинились Пасхалию вскоре после избрания. Что касается третьего, Сильвестра IV (1105–1111 гг.), то он не имел никакого влияния, хотя и продержался шесть лет. Вопрос об инвеституре прежде всего разрешился в Англии. Как только на трон взошел Генрих I (1100–1135 гг.), он немедленно обнаружил свою справедливость и хорошее отношение к церкви, призвав из ссылки епископа Кентерберийского. Тем не менее, он считал обычную власть по отношению к церкви своим правом. Вследствие этого Ансельму по возвращении было предложено принести клятву верности и получить архиепископство из рук короля. Его отказ возбудил новую борьбу, действительный спор об инвеституре, так как произвольные поступки Вильгельма II были не больше, как прихоть гонителя. Ансельм мотивировал свой отказ каноническими правилами, главным образом декретом Урбана II; переговоры короля с Римом ни к чему не привели и Ансельм снова отправился в ссылку (1103 г.). Конфликт продолжался недолго. Опасаясь угрожавшего ему отлучения, Генрих отказался от инвеституры под условием признания под присягой прелатами своих ленных обязанностей. Не соглашаясь вполне с такой аналогией, папа все же пошел на уступку. Согласно постановлению Кларендонского сейма 1165 г. (art. 2) избрание происходит в капелле короля и с его согласия, причем избранный перед посвящением приносит королю ленную присягу верности.