Его преемник Иннокентий VIII (1484–1492 гг.), кардинал Цибо, попытался восстановить порядок. Впрочем, старания его увенчались половинным успехом. Вскоре опять стали брать перевес дурные элементы. С Неаполем вспыхнула новая война. В Риме все сделалось продажным. Общество папских должностных лиц в течение некоторого времени занималось продажей фальшивых булл. Это преступление было строго наказано. Впрочем, Иннокентий для возвеличения своих родственников, именно сына (помолвленного с дочерью Лоренцо Медичи) и дочери, не жалел никаких средств.

Еще хуже пошли дела, когда престол апостола Петра занял под именем Александра VI (1492–1503 гг.) Родерих Борджиа. В высокой степени он отличался умом и большим знанием дела. Но по своей нравственной распущенности Александр стоял так низко, что в этом отношении далеко опередил свое время. Он имел нескольких детей и когда достиг тиары, то его главной целью было возвысить четырех из них, которых родила ему Ванацца Катанеи. Особенно выдающуюся роль в его истории сыграл его сын Цезарь. Последний прежде всего был сделан архиепископом Валенции и кардиналом. После насильственной смерти своего брата Иоанна (1497 г.) и с возвращением потрясенного этой смертью отца к своей обычной деятельности, Цезарь сложил с себя свой духовный сан и Людовиком XII Французским был удостоен титула герцога Валенцского. Тогда он вступил в брак с принцессой своего дома и был оделен папой Романьей, как герцогством. Планом отца и сына было создание Средне-Итальянского королевства, почему Цезарь и начал это дело с убийства и войны и не без надежды на успех. Но прежде чем строение это было завершено, Александр умер. Стремления эти не соответствовали интересам апостольского престола. Его авторитет около этого времени опять необычайно возрос, как показывает раздел папой незадолго открытого Нового света между Испанией и Португалией.

Что касается других детей Александра и Катанеи, то Готфрид (Жуффре) с рукой Санции Арагонской, незаконнорожденной дочери короля Альфонса Неаполитанского, получил княжество Скилацэ. Лукреция (Mg. Gregorovius Z. A. 1875) третьим браком сочеталась с Альфонсом д’Эсте, наследным принцем Феррарским (1501 г.), после того как ее второй брак с герцогом Бишельи трагически окончился убийством супруга ее братом Цезарем (1500 г.), а первый брак с Иоанном Сфорца де Пезаро, как и два предшествующих ему обручения, были расторгнуты папой. Для Иоанна, пожалованного Фердинандом Католиком титулом герцога Гандиа, было учреждено из разных городов герцогство Беневентское (1497 г.). Но он был убит уже через пять недель. Деяние это приписывалось разным лицам. Если только герцог не сделался жертвой любовного приключения, то наибольшее подозрение падает на Орсини. Позднее, спустя девять месяцев после происшествия, а с убийством своего зятя особенно сильно, подозрение в этом стало падать на Цезаря. Найденный доселе материал не дает веских доказательств в пользу этого, хотя и не устраняет вполне виновности Цезаря (Pastor III, 375–388; Hist. J. 1900, S. 1–21).