К сер. XIX в. обозначилось движение возвращения крещеных татар в ислам («отпавшие») и усиление культурного влияния татар-мусульман на местные и степные народы, в том числе на чувашей и мордву в Кузнецком уезде. Таким образом, вся миссия христианского просвещения среди крещеных «инородцев» грозилась полным провалом, и срочно были приняты новые усовершенствованные методики обучения. Система Ильминского основывалась на принципах обучения детей новокрещеных родителей на их родном языке, а учителями должны были быть той же национальности, имеющие качественное педагогическое образование, и «искренне православными». Книга «Закон Божий» должна быть напечатана также на родном «иноверческом» языке. Русский язык и русская транскрипция были только учебными, которые ученики должны изучать наравне с другими предметами школьного обучения.
Кроме того, предусматривалось обучение в начальных классах девочек, причем допускалось совместное обучение с юношами. В таких школах преподавались: «Закон Божий», «русский язык», «славянское чтение», инородческое чтение», «счет», «письмо», «пение» и «гимнастика». Новая инородческая школа применяла народные формы обучения и быта конкретно для каждого народа, давшие ей в глазах этих самых инородцев громадное преимущество по сравнению с теми же татарскими мусульманскими школами.
Кроме миссионерских школ, созданных для детей крещеных народностей, для татар-мусульман открылись русско-татарские школы. Это были начальные казенные школы, где обучение велось на русском языке, а на основе русской грамматики преподавались общеобразовательные дисциплины. В 1876 г. была открыта в Казани первая татарская учительская школа, где подготавливались учителя для таких школ. «Конец XIX в. – это было время, когда в силу причин политического характера происходило сужение университетской демократии, вводилось серьезные ограничения при поступлении в вузы юношей неправославного вероисповедания и из семей низших сословий. Усиливается контролирующая функция государства в образовательной системе»[149].