Если бы Португалия имела такого короля в тучные годы, народ бы им гордился, восхваляя на все лады. В условиях нескончаемой череды напастей каждое монаршее достижение воспринималось с издевкой и осуждением. Так, яхта и океанарий использовались республиканской пропагандой в качестве неопровержимого доказательства безумного расточительства королевской семьи, пример попирающего все моральные нормы пира во время чумы и наплевательского отношения к народным чаяниям.
Вслед за верой в монарха рушилась привычная двухпартийная политическая система, худо-бедно обеспечивавшая стабильность в предыдущие полвека. Традиционные либеральные организации, в том числе Партия Возрождения, раскололись. Из нее вышел бывший министр финансов и общественных работ Жоау Франку, который основал новую организацию — Либеральную партию Возрождения.
В 1906 году Карлуш I назначил Жоау Франку главой правительства. Новый премьер попробовал провести в парламенте программу необходимых стране реформ, но республиканцы и оппозиционные монархисты устроили ему обструкцию. Карлуш I распустил обе палаты и предоставил Жоау Франку диктаторские полномочия.
Решительный шаг запоздал. Франкистская диктатура, пытавшаяся предотвратить сползание Португалии в хаос, предпринявшая полезные реформы в области образования и экономики, уже не могла спасти ни страну, ни монархию.
В январе 1908 года республиканцы организовали акции в Лиссабоне и других городах. Выступления были подавлены, оппозиционные газеты — закрыты, муниципальные советы — распущены.
Ответный выпад последовал незамедлительно. 1 февраля 1908 года на королевскую семью было совершено покушение.
На открытый экипаж, в котором по центральной площади следовали Карлуш I, Амелия и их сыновья Луиш и Мануэл, напали республиканцы. Они были вооружены пятизарядными карабинами 44-го калибра, которые скрывали под плащами.
Король погиб на месте. В него попали три пули. Одна пробила затылок, другая угодила в плечо, третья — в шею, порвав сонную артерию. Старший сын и наследник Луиш получил три ранения в голову и грудь и вскоре скончался, не приходя в сознание.
Младший, Мануэл, был ранен в руку. Не пострадала только Амелия, отбившаяся от террористов пышным букетом.
Двое из нападавших погибли и были опознаны. Остальные бежали. Проведенное расследование пришло к выводу, что покушение стало делом рук карбонариев — тайного общества, основанного в конце 90-х годов. Формально оно не было связано с масонскими ложами, но фактически представляло собой их вооруженное крыло.
Убийство короля и наследного принца раскололо общество. Большинство португальцев скорбели и негодовали. Республиканцев теракт не примирил с погибшим монархом, а, напротив, ожесточил еще больше. Похороны республиканские издания описывали в злорадном, презрительном и ерническом тоне.