Как бы ни были созданы империи, ими нужно было управлять. Одной из жизненно важных функций эффективного колониального управления является создание метрополией органа власти, состоящего из верных, компетентных и в разумной степени бескорыстных чиновников-управленцев. Очевидно, в условиях XVI в. формирование такого органа было весьма непростым делом. Эта проблема стояла особенно остро и была особенно насущной в Испанской Америке, где за несколько десятилетий корона Испании завоевала государства, которые были гораздо больше по площади и численности населения, чем сама Испания. Испанская Америка была завоевана частными инвесторами и солдатами удачи, действовавшими с разрешения короны, но ни в коем случае не под ее руководством. Конкистадоры командовали своими людьми, опираясь в большей степени на их верность себе или финансовую зависимость, нежели в силу занимаемой ими должности. Они господствовали над местными индейцами по праву завоевания, которое было дополнено и смягчено миссионерским наставлением. Предоставленные самим себе, они были склонны создавать сообщества, основанные на гибридном феодализме, который во многих уголках Европы в XV в. стал уже привычным. С другой стороны, корона, движимая желанием извлекать доходы из Индий и привычкой властвовать авторитарно, была вынуждена уничтожить эту свободную личную власть и на ее место поставить централизованную имперскую администрацию, которая сама должна была назначать всех высокопоставленных чиновников и требовать повиновения им в силу занимаемых ими должностей, самостоятельно принимать все главные решения и требовать подробной, почти ежедневной информации обо всем происходящем. Учитывая обстоятельства того времени, испанская корона добилась поразительных успехов в достижении всех этих целей, особенно последней. Ничто не производит большее впечатление в архивах Индий, чем огромный объем, подробности и в целом точность сообщений, которые потоком текли в Совет Индий (Королевский и Верховный совет Индий) с каждым флотом, шедшим на восток.
Естественно, содержание такой системы требовало очень больших управленческих и церковных штатов, и разнообразные чиновники к концу XVI в. составляли значительную долю европейского населения в большинстве городов испанских Индий. Некоторые из этих чиновников были напрямую назначены короной – на самом деле самим королем из списков имен, представленных с соответствующими комментариями Советом Индий, – и получали ежегодное жалованье из казначейств провинций. Этих служащих на окладе можно разделить очень приблизительно и с большой долей совпадений на три класса: политические служащие, включая вице-королей и губернаторов провинций, которые обычно, но не всегда, были военными, что и обусловливало их назначение; судейские чиновники, включая судей и прокуроров высших апелляционных судов, которые всегда были дипломированными юристами, и финансисты, включая казначеев, ревизоров и торговых представителей, на которых лежала ответственность за провинциальную казну. Но эти старшие чиновники, получавшие жалованье, составляли лишь небольшую долю всего корпуса колониальных чиновников. Централизованному бюрократическому аппарату требовалась огромная армия служащих секретариата –