Организация подпольной работы и партизанского движения на территории, оккупированной финляндскими войсками, являлась важнейшим направлением деятельности молодого руководителя ЦК ЛКСМ Андропова в прифронтовой республике в годы войны. Подпольная работа, организованная Андроповым, проводилась против сильного, умелого и жестокого противника. На основе накопленного опыта организации подпольной работы в первые месяцы войны (далеко не всегда успешного) Андропов добился признания в необходимости учета специфики организации подпольной работы в оккупированных районах Карело-Финской республики, отличной от других регионов (Белоруссии, Украины, Брянской, Орловской, Смоленской, Калининской, Ленинградской и других областей). Это было обусловлено объективными обстоятельствами: рейдовым характером партизанской войны и отсутствием партизанских и продовольственных баз в тылу противника, относительно низким количеством населения, оставшегося после эвакуации в оккупированных районах, преобладанием мелких сел и деревень, массовым выселением русскоязычного населения оккупационными властями в концентрационные (переселенческие) лагеря. Схема нелегальной работы по принципу «агентурной цепи», созданная и внедренная в карельском подполье под руководством «Могикана» – Андропова, тождественная методам конспиративной работы из опыта организаций Коминтерна, апробированных во многих странах. Комсомольский руководитель республики осваивал эту сложную науку, требующую ума, таланта, у опытнейшего коминтерновца, который стал его учителем и покровителем – О.В. Куусинена. В работе комсомольского подполья использовались также приемы из арсенала старой финляндской социал-демократии, направленные на противоборство с финляндской контрразведкой, которую Андропов подчеркнуто называл устаревшим термином – «охранкой».

О.В. Куусинен привлек молодого руководителя к участию в разведывательной деятельности Коминтерна – внешней разведке. Об этом свидетельствуют документы – результаты деятельности Андропова в области аналитической разведки в отношении Финляндии. Нет сомнений, что подготовленные под его руководством аналитические документы представляли интерес также для органов советской внешней разведки – Первого управления НКВД – НКГБ.

В 1942–1944 гг. «Могикан» создал системную организацию подпольной работы в оккупированных финляндскими войсками районах Карелии. С его именем связаны истории героев и героинь карельского подполья. Андропова отличало умение подбирать кадры. Это редкое качество проявилось особенно в условиях, когда среди подпольщиков и партизан, с которыми работал Андропов, было немало сыновей и дочерей раскулаченных, репрессированных, расстрелянных, прибывших из мест заключения. Специфика работы молодого руководителя (за неделю до начала войны ему исполнилось 27 лет) в Карелии была связана с наследием довоенных гулаговских реалий: после оккупации финляндскими войсками 2/3 территории республики значительная часть КФССР являлась районом, который контролировался прежде бывшим гулаговским ведомством (ББК, Сегежлаг и др. довоенные советские стройки).