В фильме шла речь о рейсе в 1789 году британского торгового корабля на остров Таити под руководством свирепого капитана, жестоко обращавшегося с матросами, которые, встретив сочувствие помощника капитана, восстают, высаживаются на необитаемом острове, где создают свою колонию.

Главную роль руководителя бунта исполнял Марлон Брандо, находившийся уже на пике своей популярности. Заняты были и другие видные актеры.

Фильм был номинирован на семь «Оскаров», но не получил ни одного. Критика позитивно оценивала картину, но сетовала на ее затянутость и нединамичное развитие сюжета. В прокате «Мятеж на „Баунти“» не окупился.

Эта неожиданная для режиссера неудача (она была не столь уж значительной, так как в рейтинге фильмов 1962 года «Мятеж…» занял шестое место) вызвала у Майлстоуна чуть ли не депрессию. Он прекратил работу над фильмами и в последующие годы участвовал в подготовке двух телевизионных сериалов, снимая в них отдельные эпизоды.

С 1964 года Льюис Майлстоун не работал. Иногда он давал интервью, подчеркивая в них, что пребывает на пенсии и не стремится возвратиться в кинематографию. Он, однако, присутствовал на различных кинофестивалях. Несколько раз он приезжал в Москву, участвовал в жюри международных конкурсов. В СССР в условиях некоторой разрядки международной напряженности его встречали благожелательно, учитывая, что он покинул Россию до 1917 года, то есть не относился к «белоэмигрантам», снял во время войны два фильма, благоприятных для СССР, подвергался за них преследованиям в послевоенные годы. Он встречался с советскими кинорежиссерами Григорием Козинцевым, Леонидом Траубергом, Сергеем Юткевичем.

Льюис Майлстоун общался с писателем Ильей Эренбургом, который в своих воспоминаниях «Люди, годы, жизнь» оставил теплые строки об этом американском режиссере. С Эренбургом обсуждался вопрос о подготовке американского фильма по его роману «Жизнь и гибель Николая Курбова», посвященному России первой половины 1920-х годов. Совместными усилиями был даже подготовлен сценарий фильма, но ни одна компания в США не взялась за его создание. Как рассказывал Майлстоун, ему заявляли нечто вроде: «Слишком много политики и слишком мало любви». Совместный проект так и не был реализован.

Льюис Майлстоун скончался в Лос-Анджелесе в возрасте восьмидесяти пяти лет 25 сентября 1980 года и был похоронен на мемориальном кладбище, где покоились многие деятели американского кино. Он вошел в историю кинематографии как один из ее видных режиссеров, талант которого проявился особенно ярко в его раннем творчестве.