Попов, бывший матрос, руководивший милицией, имел в распоряжении две тысячи человек, танк и восемь пушек, которые нацелил на Кремль.
Заговорщики захватили Центральный телеграф, приказав телеграфистам не отправлять телеграммы, подписанные Лениным и Троцким, а отправить по всей России официальные депеши о низложении большевистского правительства.
В это время в Большом театре проходил V Всероссийский съезд Советов. Накануне вечером в своем выступлении перед депутатами эсерка Мария Спиридонова яростно критиковала Ленина.
На этом съезде присутствовал представитель французской военной миссии капитан Жак Садуль. Он с энтузиазмом принял Октябрьскую революцию, восхищался Лениным, считая его героем. Критику Марии Спиридоновой в адрес Ленина он высмеял:
Вечером 6 июля Ленин уже не смеялся. Дзержинский был арестован чекистами-эсерами, посол Германии убит, пушки Попова направлены на Кремль, а в тени плели заговор западные дипломаты. Ситуация была для большевиков критической.
Ленин приказал окружить Большой театр и арестовать всех левых эсеров, подавить вооруженное восстание, руководимое Поповым. Верные большевикам чекисты выполнили первую часть приказа, вторую часть его выполнить было нелегко. Опять, как и во время революции, выручил батальон латышских стрелков. Ночью в Кремль был вызван их командир, бывший царский полковник Вацетис. Произошел следующий диалог:
Лубянка была с боем взята, сопротивление батальона левых эсеров отбито, сам Попов бежал на юг и присоединился к отрядам анархиста Махно и продолжал бороться с большевиками. В 1921 году он был схвачен красногвардейцами и расстрелян. Дзержинский был освобожден. Он был жив и горел желанием отомстить. Ликвидировать левых эсеров ему показалось мало. Он хотел мести и знал, против кого ее направить. Другой латыш, Берзин, ветеран-большевик, командовавший артиллерией, был использован Дзержинским в этих целях. В дальнейшем он будет руководить НКВД и в свою очередь погибнет в сталинских чистках.