С лета 1998 года Чубайс наладил закулисные контакты с Лужковым («Ъ», 18.07.98). Особенно тесными были контакты Чубайса как раз с лужковским концерном АФК «Система» («АиФ», № 5, 1999). Внешне они были врагами, но за кулисами — соратниками по борьбе против России. К примеру, планировалось совместное участие в приватизации 25 % акций государственного «Связьинвеста», шло активное сотрудничество в информационной политике. Онэксимовские «Комсомольская правда» и лужковский «МК» синхронно выполняли задания по растерзанию того или иного политика.

Ввиду захвата крупнейшего государственного монополиста, «Система» стремилась захватить еще и наиболее удобный частотный диапазон для сотовой связи — 900 МГц. Проглотив «Мобильные телесистемы», получившие в 1993 году от государства данный диапазон при выдаче лицензии, «Система» столкнулась с фирмой «Вымпелком» («Би Лайн»), которая, как оказалось, 4 августа 1998 года получила частоту из рук Бориса Немцова («Ъ», 01.12.98). Так на поверхность всплыла закулисная сторона политических конфликтов. Но ненадолго. «Вымпелком» был встроен в иерархию «Системы» и даже получил подарок — компания первой вышла на рынок США со своими ценным бумагами.

На следующем этапе «Система» оседлала московское телевидение, захватив 67 % компании «ТВ-Центр». Это уже был мощный рычаг для давления на политическую обстановку. Всерьез им начали пользоваться только в 1999 году после кадровой чистки и налаживании мало-мальски профессионального вещания.

В обстановке развала после августа 1998 года АФК «Система», поживившаяся на кризисе, подбирала все, что плохо лежит. «Система» (через свой «Гута-банк») скушала солидный и устоявший «Промрадтехбанк», бывший уполномоченным банком правительства Москвы («Время-MN», 03.12.98), после чего «Гута-банк» перестал интересовать «Систему», и та в начале 1999-го «скинула» большую часть своих акций. Потом «Система» начала заглатывать филиальную сеть рухнувшего «Инкомбанка» — одну из наиболее мощных оргструктур, приносившую банку львиную долю прибыли («ВМ», 22.11.99). Параллельно была провернута масштабная афера по перекачиванию средств в «Банк Москвы», проглотивший через ряд манипуляций средства «Мосбизнесбанка», не рассчитавшегося с кредиторами.

Помимо «Системы», опорой лужковского олигархического клана стали банки, которым после откровенного грабежа вкладчиков при пособничестве из Кремля с августа 1998 перестали доверять граждане, но продолжали доверять Кремль и мэрия, оставившие банкам доходный бизнес от прокрутки бюджетных денег. Банки, наиболее близкие номенклатуре, «обслуживали» 30 % от консолидированного бюджета страны.