Настроения в Европе были таковы, что некоторые политики могли воспользоваться предложением мятежного архиепископа. Уже существовала антипапская коалиция Милана и Флоренции. К ним недавно присоединился заключивший мир с Флоренцией король Неаполя. Император Фредерик III и французский король Людовик XI не раз заводили разговоры о необходимости созыва Собора. Их всегда был готов поддержать французский университет, известный своими антипапистскими настроениями. Но поведение архиепископа Замометича было чересчур вызывающим и скорее походило на импровизацию, чем на действия по продуманному плану.
Сикст IV воспринял угрозу серьёзно. Он наложил интердикт на Базель, власти которого разрешили крамольные проповеди, и отправил своих послов в Базель и к императору. В декабре 1482 года городские власти Базеля арестовали архиепископа, заковали его в цепи и бросили в тюрьму. В ноябре 1484 года Замометич покончил с собой или был убит.
Сикст IV был последним понтификом, которому служил Федерико Монтефельтро. Воинственный папа пережил великого кондотьера. Портрет Сикста IV появился в библиотеке герцога до 1482 года, а то неизвестно, остался ли портрет там, потому что военную кампанию, начатую в 1482 году, Федерико Монтефельтро вёл против Сикста IV и его союзников венецианцев.
В марте 1482 года истёк срок контракта Федерико с Сикстом IV. Федерико перешёл на службу к лиге из трёх городов: Флоренции, Милана и Неаполя. Он посетил Флоренцию с дружеским визитом – к великому неудовольствию Сикста IV. Лоренцо Медичи и Федерико помирились и обменивались письмами. Инициатором примирения выступил Лоренцо. Флорентийский диктатор делал вид, что не знает о вовлечённости Федерико в заговор Пацци.
Прекращение боевых действий среди итальянских городов, последовавшее после захвата Отранто, длилось недолго. В очередном конфликте Италия разделилась на два лагеря. Папа, Венеция, Сиена, Генуя и ещё несколько городов составляли одну воюющую сторону. Флоренция, Неаполь, Милан, Мантуя, Болонья, Феррара – другую.
Венецианцы, планировавшие войну против Феррары, уговорили папу Сикста IV присоединиться к ним в атаке на город. Они попытались перекупить Федерико Монтефельтро, воевавшего на стороне короля Феррары, однако кондотьер не пожелал расторгнуть договор с королём. Тогда венецианцы наняли Роберто Малатесту.
Во время подготовки к защите Феррары Федерико подхватил болотную лихорадку и после недолгой болезни умер. За несколько дней до смерти герцог узнал о победе Роберто Малатесты над неаполитанскими войсками. Федерико Монтефельтро хорошо понимал серьёзность положения. С благословения папы римского Роберто Малатеста мог захватить Урбино. Несмотря на мучившую его лихорадку, Федерико всё же решил отправиться в Урбино. По пути домой у Федерико случился новый тяжёлый приступ болезни. Ему пришлось вернуться в Феррару. Федерико не знал, что Роберто Малатеста сам заболел, подхватив малярию. Как оказалось, Федерико Монтефельтро и Роберто Малатеста умерли в один день. Это произошло 11 сентября 1482 года. (Малярия Роберто Малатесты давно считается подозрительной; возможно, он был убит кем-то из семейства дела Ровере из зависти к военным победам зятя Федерико Монтефельтро.)