А в 2006 г. в лифте своего дома была убита известная журналистка Анна Политковская — ярая «правозащитница» и оппозиционерка, автор книг «Путинская Россия» и «Россия без Путина», вышедших в Англии при участии и финансировании Березовского. Либералы подняли шум о причастности ФСБ, о политическом терроре. Но следствие выявило, что Политковскую, всегда выступавшую защитницей чеченских «свобод», убила чеченская мафия. Организаторы действительно использовали одного офицера ФСБ и троих сотрудников МВД, купив у них адрес журналистки, данные о телефонных разговорах, подрядив их для слежки. Но цели эти сотрудники не знали, просто злоупотребляли за деньги служебным положением. Кто заказчик, доказать не смогли, но руководитель Главного управления Следственного комитета России Довгий высказал убеждение, что это Березовский, и что убийство связано не со статьями Политковской, а с ее личностью: «Вот она такая яркая, находится в оппозиции к действующей власти, встречалась с Березовским — вот ее и убили. Не верили, что мы так достаточно быстро раскроем это преступление». Это была попытка повторить украинский сценарий с Гонгадзе. Убить известную оппозиционерку — и обвинить президента, правительство, силовые структуры, раздуть бурю.
Но в Англии Березовский чувствовал себя неуязвимым. Его удавалось теснить только постепенно. Против него возбуждали новые и новые уголовные дела по обвинениям в мошенничестве, отмывании денег, хищении кредитов. Конфисковали незаконно присвоенную им государственную дачу, где прежде жил председатель Совета министров СССР Тихонов. Периодически возобновлялись неофициальные переговоры через Абрамовича. Вслед за «Сибнефтью» Березовскому пришлось продать по назначенной ему цене пакет акций «Русала», «Независимую газету» с несколькими дочерними изданиями.
А оппозиция раскачивала страну по любому поводу. Устраивала информационные атаки после каждого теракта. Созывала демонстрации в поддержку «оранжевых» на Украине, против поддержки Кремлем Януковича. Ну а политические реформы Путина после Беслана она восприняла как прямой вызов. Эти преобразования не ограничились отменой региональных выборов. Ведь таким образом менялся и состав верхней палаты парламента. Половину депутатов Совета Федерации назначали губернаторы — а теперь они и сами стали назначаемыми. Чтобы компенсировать общественным организациям возможность влиять на государственную политику, Путин создал новую структуру, Общественную палату. Но она была консультативным органом при президенте и правительстве, и ее члены тоже были назначаемыми.