С 5 июня накал страстей пошёл на убыль, и не так уж некомпетентен оказался царь Алексей уже в начале своего правления – когда ему не исполнилось и двадцати лет, если он не стал рубить буйные головы, а начал подготовку государственной реформы.
Московское восстание отозвалось восстаниями также в Сольвычегодске, Устюге Великом, Соликамске, Козлове (ныне Мичуринск), Курске, Воронеже, Осколе, Томске, Сургуте… Везде они были направлены против бояр и приказных.
О каком «раболепии» народа и «тирании» царя, якобы источающего «византийское благолепие» и признающего лишь «бессловесность», может быть здесь речь? Напротив, здесь налицо вполне определённая и достаточно ярко выраженная социальная активность масс, которые оказались способны своими действиями повлиять на власть в нужном для них направлении.
Причём характерно то, что готовность к уступкам проявила тогда центральная власть – царь, а высшее боярство своим своекорыстием провоцировало эксцессы.
1 сентября 1648 года был созван Земский собор для выработки нового свода законов. В его работе участвовал и Морозов, 22 октября вернувшийся в Москву и вновь принявший на себя бразды текущего правления. При выработке статей нового Уложения использовались и материалы «челобитных» «азовского» Собора 1642 года…
Соборным Уложением 1649 года окончательно оформилось крепостное право, была усовершенствована судебная система и впервые вводилось понятие государственного преступления. Принципиально более глубоко и широко была структурирована система управления. Разделение слобод в посадах на «чёрные» и «белые» было уничтожено, и всё население посада обложено податями и повинностями в пользу государства. Уложение 1649 года стало основным сводом государственных законов России на почти 200 лет – лишь в 1835 году появился манифест императора Николая I о введении в действие «Свода законов Российской империи».
Административная система Алексея Михайловича с её почти семьюдесятью приказами стала вершиной допетровской России и была уже весьма разветвлённой и отлаженной. При содействии царя в 1653 году принимаются Таможенный, а в 1667 году – Новоторговый уставы, способствовавшие развитию внутренней и внешней торговли. Поощрялось развитие промышленности, в России, действовали железоделательные, поташные, стекольные заводы, солеварни, имелось кузнечное, кожевенное, полотняное, мыловаренное производство…
И всё это происходило по-прежнему в атмосфере не «безгласия» и социальной инертности. Напротив, сама динамика государственного развития в условиях разделённого общества программировала волнения. Последним крупным городским выступлением на Руси стал так называемый «Медный бунт» – восстание москвичей летом 1662 года. Россия вела тогда войны с Польшей и Швецией за возврат русских земель и выход к Балтике. Государственные расходы были огромными, налоговое бремя сильно возросло. С 1654 года правительство стало прибегать к выпуску неполноценных серебряных денег, перейдя затем к «медному» обороту. При этом налоги и подати принимались только в серебряной монете.