После Смольного Хорхорина направляют в Красную армию – телеграфистом в штаб Западного фронта, а затем отзывают в Петроград и назначают военным комиссаром Управления Петроградского телеграфа и телефона и Управления коменданта Финляндского вокзала.

С февраля 1920 г. начинается служба Хорхорина в органах ВЧК-ОГПУ-НКВД. Вначале он служит инспектором районной транспортной ЧК в Москве, затем помощником особоуполномоченного и инспектором Петроградской окружной транспортной ЧК. В 1921 г. возглавляет окружную транспортную ЧК Мурманской железной дороги.

В 1922–1925 гг. служит особоуполномоченным Петроградского окружного транспортного отдела (ОТО) ГПУ по Мурманской ж.д., заместителем, а затем начальником Секретно-оперативной части ОТО ГПУ Октябрьской ж.д., зам. начальника ОТО ГПУ станции Петроград-Ленинград, пом. начальника Информотдела, начальником отделения по борьбе с контрабандой на транспорте Экономического отдела Полномочного представительства (ПП) ОГПУ по Ленинградскому военному округу, а в 1925–1927 гг. возглавляет отделение по борьбе с контрабандой Управления пограничной охраны и войск ГПУ ПП ОГПУ по ЛенВО.

В 1927–1929 гг. Хорхорин – начальник Секретно-оперативной части губернского отдела ГПУ в Архангельске, врид начальника губотдела, а затем начальник Контрразведывательного отдела ПП ОГПУ по Северному краю. В 1929–1930 гг. учится на курсах усовершенствования при Высшей пограничной школе ОГПУ СССР.

В 1930–1931 гг. помощник начальника II отделения Особого отдела, помощник начальника Секретного отдела ПП ОГПУ по ЛенВО, врид начальника Секретного отдела. В 1931–1933 гг. начальник I, IV отделения, помощник, заместитель начальника Секретно-политического отдела (СПО). Приказом ОГПУ СССР от 20.12.1932 награждён знаком «Почётный работник ВЧК-ОГПУ (XV)».

В 1933–1935 гг. начальник СПО Полномочного представительства ОГПУ – Управления НКВД по Ивановской промышленной области, помощник начальника Управления НКВД по Ивановской Промышленной области. В 1935–1936 гг. заместитель начальника Управления НКВД по Ивановской области. 5 декабря 1935 г. присвоено звание майора государственной безопасности.

В 1936–1937 гг. помощник наркома внутренних дел Белорусской ССР, начальник III отделения УГБ НКВД Белорусской ССР, заместитель наркома внутренних дел Белорусской ССР.

С 1 октября 1937 г. начальник Управления НКВД по Читинской области, начальник Особого отдела НКВД по Забайкальскому военному округу. Депутат Верховного Совета РСФСР 1-го созыва (с 26 июня 1938 г.). Председатель Особой тройки УНКВД по Читинской области, созданной по приказу НКВД СССР от 30.07.1937 № 0447. Организатор и активный участник сталинских репрессий, за что постановлением ЦИК СССР от 12.12.1937 награждён орденом Ленина. Указом Президиума Верховного Совета СССР от 22.02.1938 награждён медалью «XX лет РККА».