В Вольтерре двор Медичи принимала местная богатая семья Ингирами. В честь прибытия великого герцога Козимо II они украсили свой дворец его бюстом над дверью, а его матери, Кристине Лотарингской, преподнесли ценный подарок: реликварий с тремя терниями с тернового венца Иисуса. Этот реликварий до сих пор хранится в секретной комнате капеллы герцогов. На банкете в Вольтерре, кроме телятины и дичи, тоже было много рыбы, но на этот раз речной, из реки Эльза.
В 1617 году Козимо II был втянут в конфликт, разразившийся между королем Людовиком XIII и его матерью Марией Медичи, своей двоюродной сестрой, в связи с убийством французского советника тосканского происхождения Кончино Кончини. Французский государь потребовал конфискации активов, которыми владела семья Кончини во Флоренции, после смерти предателя. Это была даже не просьба, а приказ, против которого Козимо II не мог пойти. В 1619 году великий герцог получил просьбу от императора набрать для него полк и отправить в Германию за счет тосканского государства. Хотя это и не оказалось решающим в Тридцатилетней войне, но послужило поводом для Козимо просить императора о присвоении важного порта Пьомбино, откуда было близко до острова Эльба. Правда, уже через два года полк был уволен, и Козимо II так и не получил Пьомбино.
Герцог пытался следовать христианским идеалам в войне против турок и открыть новые торговые пути. Вместе с тосканским флотом он принял участие в нескольких экспедициях в Северную Африку, которые привели к завоеванию крепости Дисто в Негропонте и Элимано в Карамании. Козимо II также пытался поддержать шаха Персии Аббаса Великого в его попытке подорвать Османскую империю, но безуспешно. Эта операция провалилась из-за колебаний самого великого герцога, который не чувствовал себя готовым вести войну против османов, не выслушав сначала мнение папы и Испании по этому поводу. Не говоря уже о том, что освобождение Иерусалима все еще казалось недостижимой целью христиан. Кроме того, Козимо поддерживал эмира Ливана Фахр-ад-Дина, который пытался создать антитурецкую коалицию в Европе и собирал союзников. Эмир разъезжал по разным странам, гостил у Козимо во Флоренции, где его прозвали Факкадино. Но единственное, чего он смог добиться, – это восхищение флорентийцев своими пестрыми восточными нарядами. Из затеи Факкадино ничего не вышло, его планы оказались невыполнимы.
Несмотря на эти сложности и ошибки, правительство Козимо II было достаточно мудрым и справедливым. Это обеспечило Тоскане период относительного экономического благополучия и демографического роста, несмотря на повышение налогов и несколько лет неурожая. После смерти отца Козимо пришлось заниматься браками своих сестер, Екатерины и Клаудии, то есть искать женихов и выплачивать их приданое. Деньги были нужны и на содержание сестры-инвалида Марии Магдалины, и дочери Марии Кристины. А там и другие дочери, Маргарита и Анна, начали подрастать. Правда, выдавать их замуж было еще рано, но уже можно было начинать подыскивать им подходящую партию. Даже когда Козимо стал совершеннолетним, из-за плохого здоровья он с 1614 года передавал большую часть государственных дел премьер-министру Белисарио Винте и многим членам семьи, включая свою жену, брата Франческо, дядю Джованни, сына Козимо I и Элеоноры Альбицци и, прежде всего, свою мать – Кристину Лотарингскую.