Флотилия Нассау-Зигена была усилена прибытием 22 новых канонерок и теперь состояла из 1 яхты (флагман), 7 галер, 6 батарей, 4 барж, 7 дубель-шлюпов, 42 канонерок (или казачьих челнов) и 4 транспортов, а парусный флот остался таким же, как в начале кампании. Корабли Джонса начали действовать в 5.15, и вскоре после этого корабль заместителя командира турецкой эскадры сел на мель на южной стороне Лимана. Нассау-Зиген сразу же направил весь свой флот на левое крыло, чтобы атаковать терпящий бедствие корабль, и это не позволило ему эффективно действовать на правом крыле. В результате русские парусники подверглись сильному давлению, а «Малый Александр» был потоплен огнем турецкого бомбардирского корабля. Эта потеря была сбалансирована потерей севшего на мель турецкого линкора, который сожгли русские малые корабли, а турецкий флагман чуть позже разделил его судьбу.
По версии Джонса, эти корабли легко могли быть захвачены, поскольку спустили флаги до момента сожжения, но, по версии Нассау-Зигена, они отказались сдаться и продолжали вести огонь, потому и были уничтожены. В журнале «Бористена» до некоторой степени поддерживается вариант Джонса, а согласно одному рассказу, первый севший на мель турецкий корабль в действительности натолкнулся на «Св. Николая». Также следует помнить, что бессистемный ружейный огонь может быть незаметным для тех, кто наблюдает с большого расстояния, и усилен до серьезного сопротивления теми, кто находится вблизи. Кроме того, для маленьких гребных судов намного легче уничтожить большой корабль, который им противостоит, чем попытаться его захватить. Огонь продолжался до 9.30. К этому времени турки удалились под защиту пушек Очакова. Их атака оказалась неудачной. Несмотря на отсутствие координации между двумя главными частями российских сил, они сумели отбить противника с потерями большими, чем понесли сами. И капудан-паша решил уйти из Лимана, по крайней мере с парусным флотом, и ночью попытался это сделать. И тогда новая батарея на Кинбурнской косе доказала свою полезность, заставив турок держаться настолько близко к северной части выхода, что не меньше девяти кораблей сели на мель. Это дало шанс русской флотилии, и вскоре после рассвета эти корабли и еще несколько небольших судов были окружены и уничтожены. Единственным исключением стал линкор, который был захвачен и снят с мели17.
О потерях турецкого флота судить трудно. Согласно донесениям Нассау-Зигена, он уничтожил 28-го 2 линкора с 64 пушками каждый, а 29-го – 5 линкоров с 40–60 пушками, 2 фрегата с 34 пушками каждый, 1 бомбардирский корабль, 2 шебеки, 1 галеру и 1 транспорт. Его люди также захватили 1 линкор с 54 пушками. О взглядах Джонса на эти заявления мы уже упоминали. Вполне вероятно, что Нассау-Зиген преувеличил размеры и оснащенность уничтоженных им кораблей, но представляется менее вероятным, что он изменил их количество в сторону увеличения. Так что, судя по всему, турки действительно потеряли за два дня боев 15 судов, из которых 10 были линкорами разных размеров.