1590 Янсен (Jansen) изобрел микроскоп, в котором большее увеличение обеспечивалось соединением двух линз.

1665 Роберт Гук (Robert Hook), пользуясь усовершенствованным микроскопом, изучал строение пробки и впервые употребил термин клетка для описания структурных единиц, из которых состоит эта ткань. Он считал, что клетки пустые, а живое вещество — это клеточные стенки.

1650-1700 Антони ван Левенгук (Antoni van Leeuwenhoeck) при помощи простых хорошо отшлифованных линз (× 200) наблюдал "зародыши" и различные одноклеточные организмы, в том числе бактерии. Впервые бактерии были описаны в 1676 г.

1700-1800 Опубликовано много новых описаний и рисунков различных тканей, по преимуществу растительных (впрочем, микроскоп в это время рассматривался главным образом как игрушка)

1827 Долланд (Dolland) резко улучшил качество линз. После этого интерес к микроскопии быстро возрос и распространился.

1831-1833*[23] Роберт Браун (Robert Brown) описал ядро как характерное сферическое тельце, обнаруживаемое в растительных клетках.

1838-1839^* Ботаник Шлейден (Schleiden) и зоолог Шванн (Schwann) объединили идеи разных ученых и сформулировали "клеточную теорию", которая постулировала, что основной единицей структуры и функции в живых организмах является клетка.

1840^* Пуркинье (Purkinje) предложил название протоплазма для клеточного содержимого, убедившись в том, что именно оно (а не клеточные стенки) представляет собой живое вещество. Позднее был введен термин цитоплазма (цитоплазма + ядро = протоплазма)

1855^* Вирхов (Virchow) показал, что все клетки образуются из других клеток путем клеточного деления.