С точки зрения нейробиологии, началом сознания и умственной деятельности является головной мозг. Разум же является результатом взаимодействия между нейронами и считается суммой переживаний, которые влияют на открытие и закрытие нейронных цепочек в области мозга, ответственной за мораль или ценности. Разум, который был своего рода святой субстанцией в эпоху человеческой цивилизации, в постгуманистическую эпоху превращается в материальный объект. Поэтому то, что мы называем реальным, может быть заменено интерпретацией реальности, создаваемой в нашем мозге, как это было показано в фильме «Матрица». Реальность – это не просто объективная данность, а результат деятельности головного мозга, а объективное существование – это вопрос деятельности головного мозга.

В общем, деятельность мозга, как известно, состоит из чувств, эмоций, языка, движений и областей памяти. Поэтому нейробиологи считают, что нейронная активность порождает сознание. Например, объект в глазу превращается в нематериальный сигнал, который передается к нейрону через зрительный нерв. Нейроны производят электрический сигнал, называемый потенциалами действия. После этого различные комбинации нейронов, как считается, формируют сознание.

Тем не менее, главный посыл фильма «Матрица» заключается в том, что человеческое сознание можно ограничить, искусственно стимулируя нейроны, вне зависимости от того, что происходит в реальном мире. Сознание может стимулироваться электрически или химически без поступления внешней информации, без активизации памяти и лимбической системы. В случае со зрением внешнее воздействие стимулирует зрительный нерв, и генерируемый таким образом искусственный сигнал передается в кору головного мозга. Перед конкретным ответом на то, как работают нейроны, Кристоф Кох установил причинно-следственную связь между неврологическими процессами и сознательным восприятием на основе запуска нейронов. Стимулируя соответствующие НКС, можно воссоздать такой же процесс восприятия, который запускается и естественным стимулированием. И наоборот, если соответствующая группа НКС не может быть запущена, восприятие не сработает.

Система Матрицы, которая активно использует эти принципы работы нейронных структур, соединяет компьютерные программы с мозгом через биопорты (bio-port), установленные на затылке всех людей, включая членов сопротивления, в том числе самих Нео и Сайфера. Когда тонкие провода биопорта связываются с тысячами крошечных электродов в коре головного мозга, человеческое восприятие начинает функционировать на основе сигналов, получаемых от компьютера.