В то же время ни относительно долгое совместное проживание христиан и язычников в одной стране, ни некоторый синтез на уровне литературы не приводили к глубоким отклонениям ирландской церкви от общехристианских канонов. Единственный пример доктринального расхождения ирландской церкви с Вселенской – это терпимое отношение ее к учению известного британского ересиарха Пелагия (которого по-валлийски в Средние века называли Морганом: валлийская средневековая традиция также с большим пиететом относится к Пелагию и содержит упоминание о том, что последние годы жизни этот ересиарх провел в горах Уэльса).
Комментарий Пелагия на послания св. ап. Павла читали в Ирландии, и ученые острова относились к нему с почтением. Вплоть до XII в. Пелагий был популярен в ирландских монастырских школах. Но все же было бы ошибочно считать раннюю ирландскую церковь пелагианской. Да, папа Иоанн IV и римская курия в 640 г. обвиняли североирландские церкви в возрождении пелагианской ереси. Однако это обвинение вполне могло быть вызвано конфликтом вокруг даты Пасхи между ирландской церковью и Римом. В течение VI и первой половины VII в. ирландская церковь в целом пережила период споров и разногласий с Римом и остальным христианским миром. Главной проблемой был вопрос о дате празднования Пасхи.
Начиная со II в. Церковь пыталась изобрести математические таблицы, позволяющие заранее вычислять время Пасхи. Задача казалась неразрешимой, уровень математического знания на Западе не позволял ее решить. В итоге до 600 г. возникло несколько несовпадающих таблиц. Ирландцы же в VI – нач. VII в., в отличие от Рима и других церквей, пользовались более ранней таблицей ближневосточного происхождения. Это отличие было обнаружено в конце VI в., когда ирландская церковь начала миссию в Нортумбрии, что вызвало протест миссионеров, посланных Римом во главе с архиепископом Августином на юг Англии в Кент. Августин был недоволен распространением ирландской церкви и не преминул найти у нее изъян – ошибочное вычисление Пасхи.
Ирландцы же строго держались старого отсчета. Св. Колумбан писал папе Григорию Великому, что пасхальная таблица, используемая в Риме, заслуживает сожаления. Однако проримски настроенные епископы южной Ирландии послали в Рим особую миссию, в которой участвовал св. Лашрен (Молаше). Через год посланцы вернулись, и в 636 г. юг Ирландии принял новую систему отсчета Пасхи (раньше церквей севера Британии, основанных ирландцами, и севера самой Ирландии). Север Ирландии продолжал придерживаться старой системы до 704 г., последними от старого счета Пасхи отказались монастырь на острове Иона в Шотландии и церковь Уэльса.