Собственное мистическое учение Жерсона, отраженное им в трактате «О спекулятивной мистической теологии» («De mystica theologia speculativa»), содержит некоторый психологический оттенок. По его мнению, душа обладает тремя познавательными и тремя эмоциональными силами. В нисходящей последовательности в душе присутствуют чистая способность к познанию, дискурсивный рассудок и восприимчивость; тогда как последующая комбинация сил состоит из synderesis (инстинктивной потребности в разумном), а также чувственной потребности. Чистая познавательная способность, которая более всего соответствует «искре» (scintilla), является такой душевной силой, которая через естественное божественное сияние воспринимается как первооснова. Synderesis является инстинктивной силой, наделяемой Богом, с естественной склонностью к добру. Согласно Жерсону, действия познавательной и инстинктивной сил взаимосвязаны. «Возможно, что нам не удастся обнаружить познавательную способность, которая формально или в сущности не является определенно выраженным чувством, точно так же, как, по-видимому, мы не способны обнаружить чувство без наличия в нем некой способности к познанию». Знание объекта сопровождается или окружено определенной эмоциональной предрасположенностью относительно объекта, а эмоции влекут за собой некий определенный познавательный элемент.

В мистицизме проявляются две сверхъестественные силы: с одной стороны, чистая познавательная способность, а с другой – эмоциональной или волевой стороны – synderesis, который благодаря взаимодействию с познавательной способностью становится средством выражения опытного познания Бога. Мистический опыт оказывает влияние и на наиболее низменные силы, поскольку человек представляет собой единое целое, но все-таки ключевым моментом в мистическом опыте являются высшие силы. У Жерсона особенно подчеркивается роль синдересиса и любви; впрочем, для него мистический опыт является не просто знанием, а тем знанием, которое, в сущности, заключено в нем самом, то есть скорее знанием в результате непосредственного ознакомления, чем просто знанием о чем-либо. При надлежащей аскетической подготовке, а также при наличии благодати человеческий дух в экстазе стремится к Богу и способен соединяться с Ним, как бы подчиняясь воле, не похожей на экстаз, но перманентной и актуализирующей богоподобие души.

В своей оценке мистического опыта Жерсон старается акцентировать постулируемость какого бы то ни было слияния души с Богом. Мистическое слияние души и Бога для него является актуализацией душевного потенциала в его подобии идеальному принципу, в божественном рассудке. Однако указанная связь являет собой отношение между онтологически различными существами, причем различие здесь сохраняется по-прежнему, если даже интеллект просвещен Богом, а божественная воля соединяется с человеческой. Жерсон так же осторожен, стараясь не проявлять настойчивости, когда дело касается значения таинств в очищении души и ее приближении к Богу.