Однако «более продуктивная работа» часто была невозможна из-за тех колоссальных трудностей, проистекавших из реальных условий, в которых приходилось работать: отсутствие телеграфной и телефонной связи с губернским центром, угрозы бандитов, нарушение взаимодействия по вертикали «губерния-уезд-волость». Полноценного обмена информацией наладить не удавалось. Сотрудники губкомдезертир не знали местных условий, будучи оторванными от реальной обстановки на местах, слепо воспроизводили директивные документы столичной и окружной комиссий, вследствие чего контроль и отчетность носили формальный характер. В действительности сотрудники губкомдезертир не выезжали в волости. Это усугубляло разрыв между губернской властью и населением. Более того, фактически противопоставляло местное население губернскому центру. У населения вызывали пересуды нерусские фамилии руководителей: Эпштейн, Олин и другие.

Все это вместе взятое делало неустойчивым положение сотрудников комдезертиров и военкоматов, что порождало кадровую текучку. Так, на протяжении 15 месяцев сменилось около десяти председателей Осинской уездкомдезертир, один из них был арестован за ложную сводку в докладе окружной комдезертир²³. В Усольской уездкомдезертир сменилось три председателя за пять месяцев, в Оханской – столько же за аналогичный период.

Частая смена кадров была обычным явлением. Это объяснялось не только отсутствием опыта и нехваткой знаний. Причины, помимо уже указанных, оказывались самые разные: халатность, злоупотребление служебными полномочиями, перевод на другую работу, недостаток финансирования, работа по совместительству, болезни, смерть или гибель. Председатель Пермской губкомдезертир не раз констатировал: «Замечается в уездах частая перемена состава комдезов, что вредно отражается на деле»²⁴.

Наиболее частая смена кадрового состава была в Осинском уезде, о чем свидетельствует журнал протоколов Пермской губкомдезертир. В него внесены очень характерные, яркие записи: «Член Усольской укомдез товарищ Бажин Павел Сергеевич помер в Пермской психиатрической лечебнице 15 ноября 1919 года, а потому исключается из списка комдезертир с того же числа»²⁵; «Пермской уездкомдезертир объявляю выговор за написание сношения от 6 января за № 65 в грубой форме губвоенкомату, каковое совершенно не допустимо»²⁶; «объявляю строгий выговор прикомандированному к канцелярии губкомдезертир красноармейцу Пермского батальона по борьбе с дезертирством Родителеву Николаю за неаккуратный выход на занятия и предупреждаю, что в случае повторения подобного явления, будет предан суду»²⁷; «председатель Оханской укомдезертир товарищ Трошев заболел тифом и положен в лазарет, а потому члену той же комиссии товарищу Ощепкову приказываю вступить во временное исполнение обязанностей председателя уездкомдезертира»²⁸; «за неподчинение председателю и за грубость правителя дел Оханской уездкомдезертир Кузнецова на первый раз арестовываю на 10 суток с исполнением служебных обязанностей и предупреждаю, что если подобный случай повториться, то губкомдезертир принуждена будет предать суду ревтрибунала»²⁹; «объявляю строгий выговор председателю и правителю дел Чердынской уездкомдезертир за халатное отношение к служебной переписке, выразившееся в том, что бумаги рассылаются без подписи как председателя, так и правителя дел»³⁰; «председателю Кунгурской уездкомдезертир Эпштейн объявляю выговор за прения с членами комиссии»³¹.