Королевские чиновники в том году чувствовали себя в Пенсильвании неуютно. 01.03.1699 Кварри сообщал Коллегии торговли, что он вынужден проводить заседания адмиралтейского суда в 40 милях от Филадельфии – ради безопасности суда. Пенсильванцы суд этот не уважают и его распоряжениям не подчиняются. Власти колонии косвенно дают понять населению, что считают этот суд произвольным и незаконным695.

Последняя перед прибытием Пенна Генеральная ассамблея начала свою работу со странного инцидента.

В конце апреля или в начале мая 1699 г. жители графства Ньюкасл отказались выбирать членов Генассамблеи. Шериф писал Маркхэму, что вызванные на голосование люди собрались, однако кричали, что не желают избирать никого696.

10.05.1699 очередная Генеральная ассамблея открылась и избрала спикером Джона Бланстона (Blunston). Совет обнаружил, что нет протокола от шерифа графства Ньюкасл. Вместо него лежал белый лист бумаги, к которому была пришпилена записка с датою 13.03.1699 г.: «Сюда я вложил и прислал Вам имена членов Совета и Ассамблеи, избранных здесь 10-го числа сего месяца. Объяснить вам, почему выборы так прошли, превыше моих сил: мне не удалось поговорить ни с кем из выборщиков (electors) об этом». Кроме того, Маркхэм получил два письма от Джона Дональдсона, который критиковал способ проведения выборов в этом графстве. Ассамблея вызвала шерифа этого графства Джозефа Вуда (Wood), а также упомянутого Дональдсона. Вуд заявил, что написал то письмо в шутку. А Дональдсон объявил свои письма Маркхэму частными и заявил, что не желает обсуждать вопрос официально. Оба принесли извинения и поклялись в лояльности королю, собственнику колонии и пенсильванскому правительству. Тем не менее оба были смещены со своих должностей. Графство Ньюкасл так и осталось без представительства в ходе той сессии.

В ту сессию Ассамблея приняла 10 законов. Среди них был акт, вновь вводивший старый налог в 1 пенни с фунта цены собственности. Поскольку на сей раз корона от Пенсильвании ничего не требовала, собранные деньги подлежали трате на нужды колонии. В связи с инцидентом в графстве Ньюкасл был принят закон, грозивший тяжкими штрафами графству, которое в будущем не провело бы выборы представителей в Генассамблею и не послало бы их. Один из законов предусматривал назначение уполномоченных по морской торговле (commissioners of admiralty), с тем чтобы они помогали служащим адмиралтейского суда (officers of the admiralty court), учреждённого короной для всей зоны залива Делавэр. Корона теперь требовала представлять колониальные законы на утверждение в Лондон ежегодно, а не раз в 5 лет, как раньше. Пенсильвания в этой связи вынуждена была отказаться от своего обычая утверждать законы сроком только на год, и в 1698 г. законы впервые были приняты не на год только, а на неопределённый срок.