В Филадельфии Пенн был встречен очень тепло и радостно706. Правда, были люди, которых прибытие Пенна не радовало, и были недовольные властями, рассчитывавшие на его заступничество. Делавэрцы считали, что пенсильванская власть подвергает их дискриминации. Англиканам, находившимся в непривычном положении религиозного меньшинства, было плохо без обычных привилегий. Многие были недовольны земельной политикой Пенна. Среди встречавших, не выделяясь из толпы, были и судья полковник Кварри, и Джон Мур, адвокат адмиралтейского суда.

Первым делом Пенн коротко переговорил с Уильямом Маркхэмом, после чего присоединился к квакерам на дневном собрании Первого Дня. (На следующих собраниях Пенн нередко выступал как проповедник, и проповеди его выслушивались с неизменным интересом.)

Обаяние Пенна действовало почти на всех квакеров и даже на многих посторонних. Хотя он уже не был такой исключительной по значимости фигурой, как в первые годы, его прибытие заметно изменило к лучшему атмосферу в колонии. Это облегчало пересмотр Формы правления.

На первых порах Пенн не делал ничего для разрешения внутренних неурядиц, сосредоточившись на выполнении требований Коллегии Торговли, о которых он знал, хотя официальный документ, их содержавший, был ещё в пути. Ведь распоряжения всё равно надо было выполнять, а это создавало в колонии новую ситуацию, в которой недовольство выглядело несколько иначе, нежели исходно. А Пенн понимал, что ситуацию он должен сначала изучить.

Немедленно по прибытии Пенн сместил с должностей Уильяма Маркхэма и Энтони Морриса (которому ставилось в вину противодействие Адмиралтейскому суду). Маркхэм остался жить в Пенсильвании, писал в Лондон длинные письма с оправданиями всего сделанного, но высокий статус себе так никогда и не вернул. Он скончался 01.06.1704 в Филадельфии. Его зятю Джеймсу Брауну не позволили занять место в Ассамблее, а потом и вовсе увезли в Бостон для суда. Но Дэвида Ллойда Пенн смещать упорно не хотел и тянул с этим до конца апреля 1700 г.

Оппозиция была разношёрстна и слаба, но она существовала. Оппозиционеры внушали пенсильванцам, что собственник не вправе действовать как губернатор без одобрения его действий королём и принесения им присяги, как того требует парламент; что вокруг земельных пожалований слишком много жульничества, путаницы и конфликтов; что процветает скваттерство707, арендная плата часто не собирается. Главной причиной всех злоупотреблений, связанных с землёй, они считали отсутствие предварительного межевания.

Сразу же по прибытии Пенн начал изучать принятые в Пенсильвании законы. Пенн сильно подозревал, что чересчур неформальная процедура, через которую Генеральная ассамблея принимала новые и меняла старые законы, немало способствовала той «моральной неустойчивости», которую он заметил в колонии сразу же по приезде.