Впервые вражда против Ордена открыто проявилась в Португалии. Дело в том, что иезуиты выступили противниками политики министра Помбала. Тогда последний открыто обрушился против них. Повод к этому дали волнения в Парагвае, который был уступлен Испанией за колонию Сан-Сакраменто. Жители Парагвая восстали против Португалии (1750 г.). Помбаль обвинил в этом иезуитов и запретил им свободный доступ ко двору. Одновременно с этим он сделал папе Бенедикту XIV особое представление. Лиссабонский патриарх Салданха был назначен папой визитатором Ордена. Он запретил иезуитам говорить проповеди и исповедовать в пределах своего диоцеза (1758 г.). Последовавшее вскоре после этого покушение на жизнь короля Иосифа дало ему новое оружие против Ордена. Иезуиты были обвинены в активном участии в заговоре. На этом основании часть их была заключена в тюрьму, а большинство высажено на берега Папской области (1759 г.).

Немного времени спустя над Орденом разразиласьлась новая гроза — во Франции. Здесь против иезуитов выступили не только энциклопедисты, надеявшиеся тем самым поразить католическую церковь, но и янсенисты, и министр Шуазёль и, наконец, мадам де Помпадур, фаворитка Людовика

XV. Выступление последней было ответом на требование Периссо, духовника короля, об удалении ее от двора. Главным толчком к их преследованию была несостоятельность отца Лавелетта, генерал-прокуратора на острове Мартинике. Он отказался заплатить 2 400 000 франков, которые задолжал одному торговому дому в Марселе. Тогда (1761 г.) Орден судебным порядком был принужден к уплате требуемой суммы. В том же году последовали первые серьезные удары. Парижский парламент постановил уничтожить Орден (1763 г.). Король утвердил это постановление (1764 г.) после того, как в Риме категорически отказались преобразовать Орден (sint ut sunt, aut non sint). После этого община их распалась. Тем не менее, иезуиты не были еще тем самым изгнаны из Франции. Напротив, в качестве белого духовенства и под надзором епископов они могли осуществлять пастырские заботы о душе.

Так как Орден потерял две своих важных ветви, то папа Климент XIII старался прийти к нему на помощь. В своей булле «Apostolicum pascendi» (1765 г.) он дал ему новую апробацию и попытался опровергнуть те гнусные клеветы, которые были на него возведены в последнее время. Это, однако, не остановило гибели Ордена. Ныне выступила против него Испания. Деятельность Ордена была ограничена. Последователи его и друзья были смещены с высших должностей, а два года спустя все его члены были, по примеру Португалии, высажены с небольшой пенсией в Папской области (1767 г.). А так как Фердинанд Неапольский был сыном испанского короля Карла III, то акт этот сейчас же вызвал подражание в королевстве Сицилии. Под предлогом столкновения с папским престолом из-за церковных реформ также и герцог Пармский, внук Людовика XV и племянник Карла III, изгнал Орден из пределов своего государства (1768 г.). Климент XIII ответил на это увещательным посланием. Это возмутило Бурбонов. Тогда последние напали на самого папу: Франция заняла Авиньон и Венессен, а Неаполь осадил Понтекорво и Беневент.