Благодаря этой плеяде биографов, географов, историков и энциклопедистов, начиная с Ибн Асакира и заканчивая Ибн Хальдуном, Сирия и Египет эпохи Айюбидов и мамлюков не имеют себе равных среди мусульманских стран.
Последним в ряду монгольских нашествий стал поход Тимурленга (Тамерлана) на Сирию. Тимур претендовал на то, что происходит от самого Чингисхана. Словно ураган, он со своими полчищами пронесся по Центральной Азии в Западную, оставляя после себя разруху и погибель. Сирия уже в четвертый или пятый раз простерлась у ног монголов. На три дня в октябре 1400 года Алеппо отдали на разграбление. Его цитадель, возможно, в первый раз удалось взять штурмом, и захватчик положил на это столько солдат, что их трупами заполнился ров. Погибло около 20 тысяч жителей города; из отрезанных голов сложили пирамиду десяти локтей в высоту и двадцати в окружности. Бесценные школы и мечети города, воздвигнутые Нуридами и Айюбидами, навсегда были стерты с лица земли. Разгром передовых сил султана Фараджа открыл путь к Дамаску. Тамошняя цитадель продержалась месяц. В нарушение условий капитуляции город разграбили и предали огню. 30 тысяч мужчин, женщин и детей заперли в большой мечети и подожгли. От самого здания остались только стены. Цвет дамасских ученых, ремесленников, оружейников, сталелитейщиков и стекольщиков угнали в столицу Тимура Самарканд, где благодаря этому появились эти и другие искусства и ремесла. Дамаск утратил положение лидера в производстве дамасской стали. Ибн Тагриберди, чей отец был главным оруженосцем Фараджа, оставил нам графическое описание всего сирийского похода. Это, пожалуй, был самый тяжелый удар, когда-либо нанесенный городу, если не всей стране.
К 1402 году свирепый завоеватель разгромил османскую армию в Анкаре, захватил Бурсу и Смирну и взял в плен Баязида I. К счастью для мамлюков, Тимур умер в 1404 году. Его преемники истощили силы во внутренних распрях, которые позволили османам вернуть под свой контроль Малую Азию, а позднее прийти к власти в Персии династии Сефевидов.
Во второй половине XV века усилилось соперничество между мамлюкским и османским султанатами за господство в Западной Азии. Государство Сефевидов вступило в него в начале XVI века. Отношения между османами и мамлюками стали напряженными при Хушкадаме (1461–1467), который, в отличие от своих предшественников – тюркских и черкесских мамлюков, происходил из Греции, и Мехмеде II, завоевателе Константинополя. Однако конфликт перешел в стадию активных военных действий не ранее 1486 года, когда Каит-бай вступил в борьбу с османским султаном Баязидом II за обладание Аданой, Тарсом и другими приграничными городами. Ближе к концу своего правления этот султан мамлюков отправил папе римскому письмо, где грозил устроить расправу над сирийскими христианами в ответ на действия Фердинанда, уничтожавшего последние мусульманские эмираты в Испании. Вскоре после этого началась война между османами и персами, которая окончилась скорым разгромом армии Сефевидов и оккупацией Месопотамии Селимом I (1512–1520). Сефевиды были убежденными шиитами и сделали эту религию государственной. Селим заявил, что мамлюкский султан Кансух аль-Гаури (1500–1516) заключил против него договор с сефевидским шахом и укрывает у себя политических беженцев.