Именно султан Селим I (1512–1520) включил арабский мир в состав Османской империи. После своей решающей победы на Мардж Дабике он триумфально вступил в Хаму и Химс, которые оба капитулировали перед ним. Затем перед Селимом сдались Триполи, Сафад, Наблус, Иерусалим и Газа, и «никто из них не оказал никакого сопротивления». На обратном пути из Египта он провел в Сирии достаточно времени для того, чтобы укрепить свои позиции и провести реорганизацию новых владений. В видах налогообложения он поручил комиссию составить кадастр всей земли, оставив за короной большую часть плодородной равнины Бекаа и богатой долины Оронта. Разумеется, он сохранил мамлюкский порядок, при котором сбор налога отдавался на откуп (талзим) тому, кто предложит за это самую высокую цену.

Ханафитское судебное производство, предпочитаемое османами, получило в Сирии официальный статус. Законовед из Алеппо Ибрахим аль-Халяби (умер в 1594 г.) написал книгу «Мультака аль-абхур» («Слияние морей»), которая впервые увидела свет в Константинополе в 1836 году и стала руководством по ханафит-скому праву во всей империи.

Административное деление в целом сохранилось от мамлюков с небольшими изменениями в номенклатуре. Нийяба стала вилайетом, а наиб – вали. За именем вали ставился почетный титул паша; в силу этого синоним вилайета стал пашалык. Вилайет Алеппо в какой-то период включал в себя семь санджаков. Дамасский вилайет вместе с Иерусалимом, Сафадом и Газой был отдан в руки Джанберди аль-Газали, вероломного мамлюкского наиба Хамы, который последовал примеру своего коллеги из Алеппо и предал аль-Гаури. Так аль-Газали фактически сделался наместником Сирии. Но все остальные административные единицы были переданы туркам. После восстания аль-Газали Сирию разделили на три вилайета: Дамаск с десятью санджаками, главными из которых были Иерусалим, Наблус, Газа, Тадмор, Сидон и Бейрут; Алеппо с девятью санджаками, охвативший Северную Сирию; и Триполи с пятью санджаками, включая Химс, Хаму, Джабалу и Саламию. Сидон сделали вилайетом в 1660 году, чтобы он служил фактором сдерживания Ливана.

В 1724 году Исмаил-паша аль-Азм, основатель известного дамасского рода, получил дамасский вилайет. Его сын Асад, начинавший карьеру в качестве губернатора Сидона, а затем Хамы, был одним из самых известных вали Дамаска при османах. Он также надзирал за паломничеством по святым местам и, похоже, скопил огромное состояние. Его дворец в Хаме, где сейчас располагается местная школа, – одна из достопримечательностей города на Оронте. Еще роскошнее дворец в Дамаске, построенный около 1749 года и считающийся красивейшим памятником арабской архитектуры своего века. Весь его стиль, резная отделка и мозаика являют собой лучшие образцы исламского искусства в период его упадка. Мрамор для его строительства привезли из Италии. Частично разрушенный пожаром во время восстания против французского режима в 1925 году, он был отремонтирован, и теперь его занимает Дамасский французский институт. Другие потомки этого сирийского рода правили Дамаском, Сидоном и Триполи, но, в отличие от ливанских губернаторов, остались верны османскому султану, несмотря на то что некоторых из них сместили, а их собственность конфисковали. В конце жизни Исмаил провел некоторое время в тюрьме, а Асада предательски убили в бане по приказу из Константинополя.