«Дом Свободы» (так назвали губернаторский дом революционеры) оказался тесным для Царской семьи и свиты, поэтому фрейлин Государыни и приближенных Государя поселили недалеко в купеческом доме, а часть слуг жила на съемных квартирах в городе.
В Тобольске взрослые сделали все, чтобы младшие цесаревны и цесаревич продолжали заниматься. Уроки, прогулки во дворе и небольшом садике, огороженном забором, рукоделие по вечерам и чтение вслух – первое время жизнь в сибирском городе не сильно отличалась от заключения в Царском Селе. Мария Николаевна в это время много рисовала, даже больше обыкновенного, учитель английского языка Сидней Гиббс вспоминал, что она «рисовала карандашом и красками». В письмах родным в Крым цесаревна жаловалась, что ей трудно доставать краски, они в дефиците, и была благодарна учителю Пьеру Жильяру, который во время прогулок по городу смог купить необходимые для живописи материалы.
В Сибири письма из столицы, от родных и близких из Крыма для Царской семьи стали особенно ценными. Как и все, Мария Николаевна радовалась каждому полученному письму и много писала сама. Но, как и другие члены Царской семьи, она не всегда получала ответы на свои послания. Цесаревна постоянно переписывалась с родными, находившимися в Крыму, особенно активно с тетками Ольгой Александровной и Ксенией Александровной. Она описывала свой повседневный быт и небольшие события, которые вносили разнообразие в тихую, лишенную новых впечатлений жизнь цесаревны. Вот отрывок из обычного письма (из Тобольска в Крым) цесаревны тете великой княгине Ксении Александровне: «Сестры мешают писать, т. к. толкаются и громко говорят. Вообще когда мы все четыре сидим у себя в комнате, то шуму бывает очень много. Поем хорошие песни, изображаем зурну и выходит совсем удачно. Папа и сестры идут гулять и меня зовут».
Сохранились большие, со множеством подробностей жизни в Крыму, письма великой княгини Ольги Александровны в Тобольск племяннице – Марии Николаевне. Зная, как цесаревна любит детей, Ольга Александровна подробно описывает, как растет ее маленький сын Тихон и какой он забавный: «Он так уютно лежал у меня на коленях, сперва кушал чрезвычайно долго и со смаком, а затем улыбался и играл со мною, что было невозможно его оставить!» В письмах много рассказов о природе, о погоде, об общих знакомых и семейных праздниках: «Фиалки цветут в саду – не в лесу, а так, в клумбах. Знаешь, куст такой – Oleo Fragrance называется – чудно пахнут мелкие беленькие цветочки? А листья немного похоже на “Ноlly”. Теперь это тоже в цвету. Хризантемы опять начали цвести, и погода теплее, сегодня идеально было…», «Николай Александрович, будучи тоже именинником сегодня, был вместе со мною приглашен завтракать к бабушке. Ели крабы, и курицу, и печенье, яблоки…» Эти послания из теплого любимого Крыма скрашивали Марии Николаевне скучное и однообразное существование в чужом городе.