Авдотья, например, помогла перебраться в Москву отцу Иллиодору. В конце 1581 г. в Александровской слободе был отравлен мышьяком сын царя Иван Иванович. Якоб Роберт вылечить царевича не смог, а может быть и сам приложил руку к его преждевременному уходу из жизни. Авдотья сказать об этом случае ничего не могла, поскольку ее близко к болевшему царскому сыну не подпустили.

Иван Васильевич тяжело переживал утрату сына. В память об усопшем царевиче Иване он приказал раздать большие суммы денег по церквам и монастырям.

Иллиодор, во время посещения Иваном Васильевичем его храма, напомнил о бедственном положении дел в православных монастырях на Афоне. После этого напоминания царь отправил на помин души своего сына семнадцати афонским монастырям очень крупную по тем временам сумму – 3000 рублей, в том числе 500 рублей для Свято-Пантелеймонова монастыря.

Царский вклад до Афона дошел, но русские монахи уже жили только в окрестных скитах, поскольку монастырь за долги забрали себе ростовщики. Царские деньги раздали бедным и убогим. Были ли среди этих бедных и убогих русские монахи неизвестно, но летопись свидетельствует, что службы в Свято-Пантелеймоновом монастыре в этот тяжелый период не останавливались – монахи каждый день приходили из скитов, в которых жили, и проводили богослужения в монастырских храмах.

Царь после смерти старшего сына навсегда уехал из Александровской слободы в Москву. Он взял с собой дорогого ему Федора Крестьянина и назначил его настоятелем Благовещенского собора Кремля.

Александровская слобода после отъезда царя запустела. Свято-Троицкий храм лишился практически всех прихожан. Иллиодор приехал в Москву, нашел там Авдотью и поведал, что ищет место. Она переговорила с купцом Кононом Полесским и тот, будучи ктитором Ильинского храма, пристроил Иллиодора на недавно освободившееся в нем место настоятеля.

В 1584 г. умер царь Иван Васильевич. Роль в его кончине английского лекаря Якоба Роберта не ясна, однако по истечению четырехсот лет был проведен анализ царских остатков и в них нашли неимоверное количество белого мышьяка и ртути.

После смерти Ивана Васильевича престол перешел к его сыну Федору. Ирина стала царицей, а Борис Годунов – наставником при молодом и не опытном в делах государственного правления Федоре Ивановиче.

Позиции Авдотьи при дворе после этого сильно укрепились. Она стала принимать участие в решении важных государственных проблем.

В 1588 г. в Москву за милостыней приехал Константинопольский патриарх Иеремия II – жизнь православных иерархов при турецких султанах была бедной, и они искали материальной поддержки по всей Европе. Вместе с ним прибыл старый знакомый Иллиодора, теперь уже архиепископ Элассонский, Арсений. Старые друзья как-то встретились на службе в Богоявленском соборе.