По некоторым источникам, Пьетро Абано в течение двадцати лет жил в Константинополе (1270–1290). Другие исследователи утверждают, что срок пребывания был не таким долгим, а третьи вообще не упоминают о его пребывании на Востоке. В Константинополе Абано некоторое время жил, так как об этом он сообщил в одной из своих книг. В Константинополе он выучил арабский и греческий языки и познакомился с арабскими и византийскими медицинскими трактатами. Прекрасное знание арабского и греческого языков для европейца того времени были редкостью великой. После пребывания на Востоке Абано продолжил обучение в Париже, где получил степень доктора медицины и философии.

Абано быстро прославился как врач. Медицина, по словам Пьетро, является наукой практической. Он заставлял студентов, изучавших медицину, посещать госпиталь, а не ограничиваться чтением книг. Абано и сам предпочитал верить наблюдениям, а не старинным трактатам. При этом он иногда делал весьма опасные выводы. Например, наблюдая за больным, пролежавшим три дня в коме, Абано предположил, что, возможно, в истории воскрешения Лазаря происходило нечто подобное.

В биографии Абано много провалов, но известно, что в 1304 году в Париже инквизиция привлекала его к суду. Про суд инквизиции, осуждение и сожжение то ли костей Абано после его смерти, то ли его самого рассказов много, однако, к сожалению, все они позднего происхождения и относятся к категории более чем сомнительных.

Тем не менее, спор Пьетро Абано с доминиканцами и преследование его инквизиторами не были выдумкой. В начале XX века итальянский историк Санте Феррари заметил важное место в книге Абано «Примиритель расхождений между философами и особенно медиками» (48 Differentia).

«И поэтому очевидно, что Якобинцы предъявляли свои обвинения, понимая превратно мои положения. Они приписывали мне утверждение, что интеллектуальная часть души может возникнуть из потенциальных возможностей материи, а также приписывали ещё 54 ошибочных утверждений. Благодаря милости Божьей мне удалось вырваться из их рук».

Таким образом, Абано пишет, что ему удалось оправдаться. Среди всего прочего Абано обвинили в том, что он не верил в демонов и утверждал, что демонам нет места в природе. В свою защиту Абано привёл рассказ двух своих учеников, с которыми он был в Константинополе. Ученики подтвердили, что вместе с Абано посещали в Константинополе женщину, прекрасно знавшую некромантию, потому что Абано хотел выяснить некоторые тайные материи, чего он не стал бы делать, если бы не верил в некромантию и демонов. Пожалуй, защита обвиняемого вызывает не меньшее изумление, чем само обвинение.