Не менее острой была проблема военнопленных. В лагерях и тюрьмах томилось более 400 тыс. военнопленных: 193,7 тыс. северян на Юге и 214,9 тыс. южан на Севере. Более 30 тысяч пленных армии Союза и почти 26 тысяч заключенных Конфедерации погибли в неволе. Смертность в южных местах заключения была выше: в северных тюрьмах умерли 12 % заключенных южан, по сравнению с 15,5 % в южных тюрьмах [1665]. Особенно ужасными условия содержания военнопленных были на Юге. Наиболее мрачной известностью пользовалась тюрьма Либби в Ричмонде и лагерь военнопленных в Андерсонвилле (Джорджия), который был впоследствии назван первым в истории «лагерем смерти». Он действовал в феврале 1864 — мае 1865 г. В конце августа 1864 г. общее число узников составляло около 33 тыс. человек. Из-за постоянной переполненности многие узники спали на земле в любую погоду, не имея возможности найти укрытие. Летом 1864 г. смертность среди заключенных составляла около 100 человек в день. Всего через Андерсонвилль прошло, по разным оценкам, от 45 до 52 тыс. человек, свыше 13 тыс. из которых умерли[1666]. Его комендант Уирт после войны был повешен по приговору суда.

Весьма сложным было положение дел на оккупированных территориях. Военная обстановка создавала особые условия, когда нарушение прав и свобод становилось неизбежностью. Не случайно просветители опасались постоянной армии как института. Красноречивым примером служит деятельность генерала Бенджамина Батлера в Новом Орлеане. Его поведение в качестве командующего оккупационными силами Союза в Новом Орлеане в течение всего восьми месяцев в 1862 г. породило среди южан зловещую, устойчивую репутацию, с которой во время Гражданской войны мог соперничать только генерал Уильям Шерман после его марша по «выжженной земле» через Джорджию. Получил прозвище «зверь Батлер» за жесткую политику в Новом Орлеане, особенно за печально известный «женский приказ» № 28.

С самого начала жители Нового Орлеана относились к солдатам Союза с презрением. Женщины, в частности, словесно оскорбляли солдат, пели в их присутствии сепаратистские песни. В солдат плевали, а ночные горшки сбрасывали с балконов на проходящих мимо янки. Ухудшение ситуации побудило Батлера издать общий приказ № 28, который гласил: «Новый Орлеан, 15 мая 1862 г. Поскольку офицеры и солдаты Соединенных Штатов подвергались неоднократным оскорблениям со стороны женщин (называющих себя дамами) Нового Орлеана в обмен на самое учтивое поведение и вежливость с нашей стороны, приказано, чтобы впредь, когда любая женщина словом, жестом или движением оскорбляет или выказывает презрение к любому офицеру или солдату Соединенных Штатов, она будет рассматриваться как проститутка и считаться подлежащей соответствующему обращению»[1667]. По этому приказу была заключена в тюрьму Евгения Леви Филлипс. Основанием для ее задержания явилось то, что она «смеялась и издевалась» над останками союзного лейтенанта Джорджа Коулмана во время его похорон. В тюрьме она находилась в довольно суровых, но обычных условиях, которые южане сочли «жестокими и позорными», а саму Филлипс стали считать мученицей Конфедерации[1668]. Батлер также приказал повесить горожанина Уильяма Мамфорда за оскорбление союзного флага[1669].