Оценив былую красоту дворца и проявив уважение к вотчине династии Романовых, которую она теперь стала олицетворять, Екатерина распорядилась немедля начать подновление резиденции. Для оценки предстоящих работ вновь в Коломенское приехал зодчий Мичурин с немцами-плотниками, уже в ноябре доносивший: «По осмотру с плотничным мастером Арнальтом, оказалось как в стенах, полах, потолках, так и в прочем того дворца не малые худоба». Летом 1763 года Мичурин сообщал подробности:
«1) В стенах, как от каменного фундамента нижние, так и по поверхности к крышкам многие ряды бревен, а паче углы и замки оных сгнили;
2) у сеней и переходов, которые забраны досками брусья, а у крылец в ступенях и площадках доски и прочее совсем обветшали, а некоторые от ветхости обвалились;
3) имеющиеся над корпусами крыши пришли в худобу;
4) сверх показанных ветхостей стены того дворца пошатились и каменный фундамент, на котором оные основаны, во многих местах повредился ж.
И за теми обстоятельствами по мнению нашему имянованных, починкою исправить того дворца невозможно; а надлежит оной, по мнению нашему, разобрав весь перестроить вновь и годные от той разборки материалы для употребления в перестройку выбрать и включить к числу новых материалов. Имеющиеся ж при том дворце каменные флигеля для служб починкою и переправкою возобновить можно. А таким образом расположению комнат и протчего упоминаемого Коломенского дворца впредь быть надлежит, оное предаем нижайше на высокое рассуждение».
В переводе на современный язык вывод был таков: дворец для жизни непригоден, особенно для драгоценной жизни императрицы. А потому высочайшее рассуждение себя ждать не заставило и отправило в Коломенского другого видного зодчего – Карла Бланка, подсчитавшего, что на полное восстановление дворца требуется довольно немалая сумма – 56 934 рублей. За такие деньги можно было выстроить новый дворец, что и подтвердил впоследствии привлеченный в качестве эксперта Василий Баженов.
Осенью 1766 года по повелению Екатерины II и началось строительство нового царского дворца рядом с храмом Вознесения, ради чего разобрали Скотный и Конюшенный дворы. Дворец нужен был к 1767 году, когда императрица намеревалась совершить свой второй визит в Первопрестольную. Одновременно началась разборка старого дворца, еще обещавшего послужить в виде стройматериалов.
Нам известны фамилии организаторов строительства, но вновь остались в забвении имена зодчих, такова, видно, их планида. Отвечали за возведение новой царской резиденции московский главнокомандующий граф Петр Салтыков и чиновник Дворцового ведомства князь Петр Макулов, коими императрица осталась довольна: «С большим удовольствием усмотрела, что Коломенский дворец совсем к Петрову дню поспеет, за что вам благодарствую, а кн. Макулова без награждения не оставлю. Я рада, что сего честного человека узнала». Петров день отмечался на Руси 29 июня, а по старому стилю 12 июля. Это была макушка лета.