В крыше павильона имеется крестообразный фонарь дневного света. Освещение решено в виде кольцеобразной люстры, висящей в полусфере, а также светильников дневного света на алюминиевых подвесных потолках.

Для выбора проекта станции решили возродить практику конкурсных отборов. В 1987 г. первую премию и право реализации получил проект, выполненный в ООО «Архитектурная мастерская Рапопорта Е. М.» с участием архитекторов Е. М. Рапопорта, Г. А. Васильева, А. К. Кривцуна. Этот проект произвел очень большое впечатление и получил хорошие комментарии в прессе. За архитектурное решение руководитель авторского коллектива Е. М. Рапопорт награжден Золотой медалью Российской академии художеств (2000 г.) и Золотым дипломом лауреата Международного архитектурного фестиваля «Зодчество-2001». В 2000 г. работа выдвигалась на соискание Государственной премии России по разделу «Литература и искусство».

Евгений Михайлович Рапопорт уже был знаком петербуржцам по станции «Площадь Мужества», а Георгий Александрович Васильев – по станции «Улица Дыбенко».

«Крестовский остров» – колонно-стеновая станция глубокого заложения, имеет традиционную дорическую ордерную систему. Колонны здесь полностью сооружены из железобетона, из-за этого они кажутся более массивными. Евгений Рапопорт так сказал о своем проекте: «Основой архитектурного образа стала заданная конструкция подземного зала с его мощной колоннадой – своеобразного архетипа древ – ней архитектуры. Здесь нет дорики в прямом смысле, есть ассоциации, переосмысление, ирония… Ордер здесь усилен, укрупнен. Минимально необходимая детализация – залог, как представлялось, выразительной простоты и монументальности».

Композиция в торце станции

Цельность архитектурного решения подчеркивает сочетание травертина в отделке путевых стен и характерного для Петербурга светлого алексеевского известняка в отделке колонн и арок. Пол покрыт темно-красным и серым полированным гранитом различных пород.

Первоначальный проект предусматривал размещение в торце станции мозаичного панно, выполненного из натурального камня. В дальнейшем вместо привычной мозаики на торцевой стене станции впервые в российском метро установили зеркала, создающие иллюзию глубины, не существующей в реальности.

Также впервые использовано римское обозначение года открытия станции – MCMXCIX. Оно расположено в торце, на фризе фронтона, отделенного от арки.

В простенках между колоннами над скамейками расположены 12 круглых мозаичных панно диаметром 150 см из натурального камня, посвященные островам и рекам Санкт-Петербурга. Эти декоративные украшения появились только весной 2001 г., до этого вместо них были сквозные круглые отверстия. В нижнем эскалаторном зале находится памятная табличка, на которой сообщается, что художественное убранство станции – дар аэропорта «Пулково» в честь 300-летия Петербурга.