Руководство республики не устраивала напряженность в отношениях между муфтиятом и имамами. Возникла угроза целостности духовного управления. Так, например, в устав Альметьевского мухтасибата были внесены изменения. Избранный имам-мухтасиб заявил о намерении состоящих в возглавляемой им религиозной организации общин выйти из ДУМ РТ и присоединиться к Совету муфтиев России[956]. С подобными же заявлениями еще перед выборами муфтия выступал Г. Галиуллин, отметивший следующее:

У нас есть три пути. Первый – если на курултае по избранию муфтия участвуют правоохранители, люди из власти, мечети выходят из духовного управления. Второй – присоединиться либо к Центральному духовному управлению, либо к Совету муфтиев России, либо к Нижегородскому муфтияту. Третий – организовать новое Духовное управление[957].

У нас есть три пути. Первый – если на курултае по избранию муфтия участвуют правоохранители, люди из власти, мечети выходят из духовного управления. Второй – присоединиться либо к Центральному духовному управлению, либо к Совету муфтиев России, либо к Нижегородскому муфтияту. Третий – организовать новое Духовное управление[957].

Иными словами, если бы недовольным главам ряда мусульманских общин удалось реализовать свое намерение, это означало бы ликвидацию монополии ДУМ РТ в исламском сегменте религиозного рынка республики[958].

Ситуация усугублялась тем, что проблему невозможно было решить привычными административными методами (вынудив Файзова уйти в отставку), поскольку муфтий пользовался покровительством Москвы[959]. Вопрос об уходе муфтия стал активно обсуждаться вскоре после того, как в Казани 19 июля 2012 г. произошел двойной теракт, в результате которого сам Файзов был легко ранен, а его заместитель Якупов – убит. В этих преступлениях были обвинены ваххабиты[960]. По словам Р. В. Айсина, после покушения на муфтия между Казанью и Москвой велись переговоры об отставке Файзова. В результате федеральные власти согласились, и муфтий подал заявление об отставке[961].

Возможно, желание Казанского Кремля оградить муфтият от вмешательства извне, совпавшее с намерением куратора исламских религиозных объединений в Администрации Президента России А. А. Гришина ослабить Совет муфтиев России, вызвало к жизни решение о прекращении сотрудничества ДУМ РТ с СМР. Вот как обрисовывает сам А. А. Гришин предысторию окончательного разрыва татарстанского муфтията с Советом муфтиев:

…после одного из моих разговоров с президентом Татарстана М. Ш. Шаймиевым татарстанские власти совместно с муфтиями пришли к выводу о необходимости вывести местный муфтият из СМР. Это случилось как раз после объединительного процесса под руководством А. Ниязова, в проекте которого интересы Татарстана, мягко говоря, не учитывались[962].