Приказом начальника Главного политического управления политической пропаганды от 28 июня 1941 г. при Военно-политической академии имени В.И. Ленина были сформированы Военно-политические курсы со штатной численностью слушателей 940 человек из числа личного состава Московских Ленинских курсов при ЦК ВКП(б). При Военно-политическом училище Красной Армии имени В.И. Ленина были сформированы Военно-политические курсы со штатной численностью слушателей 840 человек. На их укомплектование был направлен личный состав Ленинских курсов при ЦК ВКП(б). Кроме этого, Народному комиссариату обороны также передавались курсы военной подготовки и переподготовки руководящих работников партийных комитетов, реорганизованные впоследствии в трехмесячные курсы по подготовке среднего политсостава.
Резерв политсостава первой очереди для наземных и военно-воздушных частей и соединений готовился на двухмесячных курсах, созданных при 11 академиях, курсах и школах. На этих же курсах шла подготовка членов военных советов и начальников политотделов армий, комиссаров дивизий и авиаполков. Военно-политические учебные заведения создавались также при фронтах, флотах и армиях. Для ускоренной подготовки политсостава создавалась и широкая сеть военно-политических курсов. С конца 1941 г. на каждом фронте начали действовать трехмесячные курсы младших политруков.
В 1941 г. ввиду сложной обстановки на фронте некоторые военно-политические училища вынуждены были прекратить занятия и в полном составе или частично в качестве обычных воинских частей вступить в бой с противником. Например, сводный батальон курсантов Московского военно-политического училища участвовал в боях под Москвой на можайском направлении, Высший военно-педагогический институт Красной Армии вел боевые действия за город Калинин, курсанты Военно-морского политического училища обороняли город Ленинград с началом его блокады[287].
На некоторые военно-политические учебные заведения в то время возлагалось также формирование частей и соединений Красной Армии. В связи с этим часть курсантов направлялась в формируемые соединения в качестве рядовых. Так, в июле 1942 г. по решению Ставки Верховного Главнокомандования из 16 военно-политических училищ были посланы во вновь формируемые части 4500 курсантов[288].
Негативно отразилась на работе многих учебных заведений передислокация, связанная с отходом частей Красной Армии в тыловые районы страны. В 1941 г. в тыловые районы страны передислоцировалось более ¼ всех военно-политических учебных заведений. Им приходилось заново создавать учебные кабинеты, классы, стрельбища и т. п.