Бенкендорф находился рядом с Николаем на Сенатской площади (Александр Христофорович называет заговорщиков не иначе, как «позорным обществом»), участвовал в допросах своих бывших друзей, и Николай не забыл его верности. Впоследствии Бенкендорф неоднократно передавал императору просьбы родных декабристов о смягчении участи ссыльных, улучшении условий их жизни. И император откликался на его ходатайства. В частности, один из боевых друзей Бенкендорфа, декабрист Сергей Волконский, писал, что именно Александру Христофоровичу он обязан сохранением своего имения.
Другим знаком доверия императора стало назначение Бенкендорфа главой III отделения Собственной Его Императорского Величества канцелярии. Под его руководством жандармы должны охранять безопасность государства от внутренних угроз: политического экстремизма и крестьянских выступлений, подобных пугачевскому бунту, а также заниматься выявлением фальшивомонетчиков, религиозных сект, расследованием деятельности иностранцев на территории России, контролем тюрем и наблюдением за ссыльными, собирать статистику о преступлениях и только после того — театральной и издательской цензурой.
В 1828 г. Бенкендорф сопровождает государя в турецком походе и принимает участие в нескольких сражениях. Александр Христофорович с Николаем во время его поездки в Варшаву в 1829 г., для коронации короля Польши. Польская коронация 1829 г. стала первой и последней для российских самодержцев. Уже совсем скоро, после Польского восстания 1831 г., Конституция Польши упраздняется, начинается насильственная русификация Царства Польского и превращение его в Привисленский край Российской империи. И Бенкендорф будет обвинять поляков в самом страшном вероломстве: «Народ, который сейчас с воодушевлением сбегался поглядеть на своего короля, а несколько месяцев спустя в приступе безумия ряд людей объявят его отрешенным от власти».
В 1830 г. Александр Христофорович назначается членом Государственного совета, а еще через два года Бенкендорф возведен в графское достоинство и пожалован орденом Св. Андрея Первозванного.
В 1831 г. Бенкендорф рядом с Николаем при подавлении холерных бунтов, а десятью годами позже он командирован в Лифляндию для усмирения происходивших крестьянских беспорядков.
Скончался граф осенью 1844 г., простудившись во время очередного путешествия. Легенда гласит, что император проводил Александра Христофоровича в последний путь такими словами: «В течение 11 лет он ни с кем меня не поссорил, а примирил со многими».