В этих условиях английское противодействие иммиграции вызывало резкий и решительный отпор Хаганы. Ее бойцы-водолазы подорвали минами сторожевик «Эмпайр Райфл». После трагедии судна «Эксодус», на котором 4500 олим были возвращены в лагеря Европы, бойцы Хаганы сделали все, чтобы они смогли нелегально перебраться в Палестину. В общей сложности после Второй мировой войны на 64 судах к берегам ее отплыли 74 тысячи репатриантов из Европы, и почти все они смогли пробиться в Израиль. Тысячи смелых бойцов из их числа вступили в Войну за независимость, и 500 олим погибли в этой борьбе.
Между тем весной 1946 года англичане составили план ликвидации самой активной части Хаганы — подразделений Пал-маха и руководства военной организации евреев. Этот план стал известен службе информации Хаганы, и когда в июне его стали осуществлять, то хотя англичане и арестовали 2700 человек, но выделить из них бойцов Палмаха им не удалось. Они захватили также центральный склад оружия. Хагана стала готовить ответные действия, но Еврейское агентство и его президент Хаим Вейцман приказали отменить все операции, считая, что они будут равносильны объявлению войны. Было принято решение о прекращении активной борьбы с британским режимом.
После этого с англичанами активно и вооруженным путем боролись только ЭЦЕЛ и ЛЕХИ, а Хагана в ряде случаев даже помогала англичанам, похищая и порой выдавая бойцов террористических организаций. Многие члены Хаганы были возмущены этим, а начальник Верховного командования Моше Снэ в знак протеста ушел с поста члена правления Еврейского агентства.
Бездействие Хаганы продолжалось 14 месяцев. 29 ноября 1947 года Генеральная Ассамблея ООН утвердила план раздела Палестины на два государства — еврейское и арабское. А уже в полночь 30-го командование Хаганы объявило всеобщую мобилизацию, ибо не возникало сомнений, что арабские страны попытаются вооруженным путем не допустить образования еврейского государства.
В то время именно Хагана была единственной достаточно мощной вооруженной силой, на базе которой могла быть создана регулярная армия Израиля. Хотя она и находилась в подполье, но тем не менее была очень многочисленной организацией. В некоторых районах почти все мужчины и женщины, способные держать оружие, являлись ее членами.
К ноябрю 1947 года Хагана основные силы сосредоточила в трех городах. В Тель-Авиве в составе ее было 8 полевых рот общей численностью 1200 человек, отдельные роты полностью укомплектованы демобилизованными солдатами. Резервом были 2000 подростков, членов военизированной организации «Гадна». В окрестностях Тель-Авива находилось 10 охранных частей — 4 тысячи человек.