Обсуждалась возможная демаркационная линия между русской и британской сферами влияния. Коковцов предлагал, чтобы она проходила от Касре-Ширина через Хамадан, Тегеран и Мешхед к Гоудану на русской границе. Начальник Генерального штаба генерал Палицын хотел бы провести ее гораздо южнее, от Касре-Ширина на Исфахан, включив в русскую зону Керманшах, далее на Йезд и оттуда к афганской границе. В этом случае в русскую зону попал бы весь Хорасан, и Россия была бы обеспечена уже построенными стратегическими дорогами в Афганистан, проходящими через Северо-Восточную Персию».

Извольский принял предложения Палицына в отношении демаркационной линии и включил их в русский вариант соглашения, который вручил Николсону 20 февраля. 10 марта британцы ответили, что не могут согласиться на то, чтобы русская зона граничила с Афганистаном.

С приходом весны переговоры пошли быстрее, в июне возникло препятствие: британцы предложили включить в преамбулу будущего соглашения упоминание «об особых интересах, которые имеет Великобритания в Персидском заливе». Извольский решительно возражал, аргументируя это тем, что англо-российская конвенция не должна затрагивать интересы третьих держав, поскольку он дал Германии соответствующие заверения. Николсон, считая, что настойчивость в этом вопросе может поставить под угрозу успех переговоров, добровольно отказался от этого требования. Извольский, в свою очередь, согласился, чтобы к конвенции была присоединена записка Грея, утверждающая особое положение Англии в заливе при согласии на это России.

Пока в Санкт-Петербурге шли переговоры, в Тегеране вспыхнула революция, осложняя дело и грозя уничтожить сложную структуру компромиссов, подготовленных Николсоном и Извольским. Персидские националисты в августе 1906 г. нашли убежище в саду британской дипломатической миссии. Тогдашний поверенный в делах И. Грант-Дафф не мог отказать в традиционном праве на «баст» (убежище) толпе, одним из лидеров которой был сейид Абдолла Бебехани, давний друг англичан. В течение нескольких лет британцы подстрекали духовенство к выступлениям против русских займов и концессий. Разница между «конституционными» и другими средствами оппозиционной борьбы была ясна английским дипломатам в Тегеране, выпускникам Оксфорда и Кембриджа; но для персов, подданных деспота, понятие «оппозиция» являлось синонимом мятежа. Поэтому деятелям оппозиции пришлось искать защиты за высокими кирпичными стенами сада британской миссии, и Грант-Дафф не мог захлопнуть перед ними ворота.

Русская дипломатическая миссия была в курсе дружеских отношений между муллами и англичанами. Советский историк М.С. Иванов ссылается на документ в Центральном государственном историческом архиве Ленинграда, который показывает, что в августе 1906 г. Грант-Дафф вручил сейиду Абдолле Бебехани письмо с благодарностью ему и сейиду Мохаммаду Табатабаи «за их близость к британской дипломатической миссии». Документ утверждает, что в письме британцы гарантировали каждому из двух муджахидов пенсион в 1500 туманов в месяц. То, что англичане в Тегеране симпатизировали националистическому движению, не было ни для кого секретом.