В 1960-е гг. в Азербайджане действовали 2 армяно-григорианские церкви, одна в Баку, вторая в Кировабаде. Епархиальный совет Армянской григорианской церкви в Азербайджане находился в Баку. Его возглавлял Азат Сантурян, турецкий армянин, родившийся в 1920 г. в Сивасе. В 1924 г. он вместе с семьей переехал в Бейрут. В 1935 г. по окончании школы-семилетки учился в немецкой лютеранской религиозной школе в Иерусалиме. В 19391945 гг. работал в английской компании в Бейруте, а в 1947 г. в ходе кампании по репатриации, объявленной Советским Союзом, перебрался в Советскую Армению. Он получил образование в духовной семинарии Эчмиадзина. В 1961 г. был назначен председателем Епархиального совета Армянской церкви в Азербайджане.
А. Сантуряну предоставили квартиру в Баку, однако он жил в Эчмиадзине и приезжал в Баку только по большим церковным праздникам на 2–3 дня. После визита в Баку католикоса Вазгена I он стал ежемесячно приезжать в Баку на 7–8 дней [1338]. В феврале 1961 г. Вазген I решением Высшего духовного совета Эчмиадзинского католикосата заменил руководителя расположенной в Баку духовной епархии архимандрита Тирайра Мартикяна на Егише (Саркиса) Саркисяна. Архимандриту Е. Саркисяну был назначен ежемесячный оклад в 150 руб. и выделено 100 руб. на представительские расходы ежемесячно[1339].
Уполномоченный по Азербайджанской ССР Совета по делам религий часто получал жалобы на служителей епархии Армянской церкви. Армянские религиозные деятели, назначенные из Эчмиадзина, под разными предлогами уклонялись от уплаты налогов и толковали в свою пользу письмо Министерства финансов СССР от 13 декабря 1946 г. и 19 пункт закона «О подоходном налоге населения», принятого Президиумом Верховного Совета СССР. Проверка, проведенная финотделом Сталинского района г. Баку, выявила уклонение от уплаты налогов со стороны архимандрита Тирайра Мартикяна и служителей армянской церкви Г. Гулгазова, Г. Гагояна и В. Аракеляна. Результаты проверки финотдела были направлены в письменной форме архиепископу Высшего духовного совета Эчмиадзинского католикосата Сааку, а их копия – Совету по делам религий при Совете министров Азербайджанской ССР[1340].
В начале 1960-х гг. имел место скандал со священником армянской церкви Карапетом Овнаняном. Уполномоченный по делам религий М. М. Шамсадинский получил анонимное письмо за подписью «Атеист», в котором говорилось: «Священника Бакинской церкви Карапета Овнаняна в 1957 году церковный совет и начальник Епархии Тирайр Мартикян “вежливо” снял с работы за колдунство, спекуляцию маслинами, другим дефицитным пром. и прод. товаром. В этом же 1957 году он получил назначение в город Орджоникидзе. В 1960 году в мае месяце из весьма достоверных источников стало известно, что уполномолченный по религиозным культам С/О АССР “вежливо” предложил ему уехать в другой город по своему желанию. Для защиты оставить его в городе Орджоникидзе Епархиальный начальник Ростовской области Епископ Гарегин и церковный совет с 800 подписями верующих разных национальностей и разных религиозных сект обратились к начальству указанного уполномоченного с целью оставить священника Тер-Карапета Арутюновича Овнаняна на работе в их церкви, но уполномоченный категорически отказался. Следует ли запросить в Орджоникидзе, по какой причине убрали этого священника?? Всего через несколько месяцев указанный священник опять в Бакцеркви и, видимо, опять занимается спекуляцией. Он купил и отправил в Ереван несколько радиоприемников большой марки, телевизоры, стиральные машины, холодильники, маслины и другие товары. Удивительно то, что эти предметы приносят без особого затруднения прямо к нему в квартиру по адресу: проспект Ленина, № 18, постоянному жильцу Балаяну» [1341]. Для прояснения вопроса М. М. Шамсадинский обратился к уполномоченному по делам религий Северной Осетии: «Решением Верховного Армянского Духовного Совета Овнанян Тер-Карапет Арутюнович назначен в Бакинскую армянскую церковь на должность священника. По имеющимся у нас непроверенным сведениям, Овнанян служил в г. Орджоникидзе и был снят Вами с регистрации. Поэтому прошу Вас сообщить мне, служил ли он действительно у Вас? Если да, то какой период времени и за что был снят с регистрации?»[1342] В ответ на это обращение и. о. уполномоченного П. Хосроев сообщил следующее: «Священник Овнанян Карапет Арутюнович работал в гор. Орджоникидзе в армяно-григорьяновской церкви священником с 14 октября 1959 года по 9 мая 1960 года. Овнанян К. А. был снят с регистрации за самовольное хождение с молебствиями по домам верующих без приглашения по заранее составленным спискам в дни пасхальных празднеств» [1343].