В 1960 г. католикос направил священником в армянскую церковь г. Баку епископа армянской епархии в Грузии Комитаса, репатриировавшегося в СССР из Сирии в 1947 г. Учитывая, что это был второй священник-репатриант после Овнаняна, уполномоченный по делам религий предположил, что таким назначением Эчмиадзин преследует цель роста религиозного движения среди армян, проживающих в столице Азербайджана. Кроме того, он выражал мнение, что Эчмиадзин желает укрепить находившийся в Баку «Азербайджано-Туркестанский епархиальный совет», притом что за Каспием не существовало зарегистрированных армянских церквей, подчинявшихся этому совету. Ввиду этого уполномоченный по делам религий считал нецелесообразным сохранение в Баку епархиального совета для обслуживания только 2 действовавших церквей[1344].

Дальнейшее разбирательство, проведенное уполномоченным по делам религий, показало, что Карапет Овнанян родился в 1910 г. в Киликии, закончил духовную семинарию в Ливане в 1928 г. и репатриировался в Советскую Армению в 1947 г. В первый раз он был назначен священником в Бакинскую армяно-григорианскую церковь 25 сентября 1956 г. и отстранен от работы там 29 мая 1959 г. Кроме письма «Атеиста» об Овнаняне написали анонимное письмо из Орджоникидзе, называя его «социально опасным элементом»[1345].

Религиозная активность бакинских армян не носила массового характера. По праздникам в церкви собиралось до 1 000-1 500 чел. В 1961 г. на Пасху, Рождество и другие праздники в религиозных обрядах приняло участие в общей сложности 2 490 чел., а в 1969 г. -2 230 чел. В 1961 г. в армянской церкви были проведены 171 крещение, 46 отпеваний. В 1969 г. – 250 крещений, 50 отпеваний. 87 % дохода армянской церкви в Баку давала продажа свечей, крестов и других религиозных атрибутов. В 1961 г. доход армянской церкви на территории Азербайджанской ССР составил 32 433 руб., в 1969 г. – 59 417 руб.[1346] За счет этого дохода содержались не только священнослужители, но и хор Бакинской армянской церкви в составе 11 чел. В хоре участвовали, получая зарплату, студентка Бакинской консерватории Джемма Карапетовна Чергоголян, учащиеся музыкального училища Флора Степановна Багирова, Нина Вартановна Годагян и другие [1347].

В июне 1969 г. католикос всех армян Вазген I в третий раз за время своего пребывания во главе церкви посетил Баку. До этого он был там с 16 по 19 июня 1962 г. Тогда он встретился с шейх-уль-исламом Мохсуном Хакимзаде, руководителями Русской православной церкви в Баку, имел 30-минутную встречу с председателем Совета министров республики Э. Н. Алихановым[1348]. В субботу 7 июня 1969 г. в аэропорту приехавшего в третий раз в Баку католикоса встречал глава армяно-григорианской епархии Иусик Сантурян, члены церковного совета Мирзоян, Кахраманян и Атаджанян, уполномоченный по делам религий Абдулла Ахадов, представитель шейх-уль-ислама мулла Бюльбюль Мамиев, муфтий, священник Русской православной церкви отец Павел и другие.