К октябрю 1929 г. в центральном аппарате ОГПУ действовало восемь «троек» при контрразведывательном, специальном, оперативном, транспортном отделах, экономическом управлении и Главном управлении пограничной охраны войск ОГПУ. Существовала «тройка», рассматривавшая дела сотрудников ОГПУ и граждан, отбывших сроки в лагере или ссылке. Циркуляром ОГПУ от 29 октября 1929 г. эти «тройки» были упразднены. Вместо них учреждались три «тройки»: начальника секретно-оперативного управления Артузова, начальника экономического управления Прокофьева и особоуполномоченного Коллегии ОГПУ Фельдмана. Они предварительно просматривали законченные следствием дела, поступавшие из центрального аппарата и местных отделов, и докладывали о них на судебных заседаниях Комиссии или Особого совещания[760].

Копии приговоров Комиссии и Особого совещания отправлялись на исполнение в соответствующий отдел ГПУ – ОГПУ или в адмотдел при губ(окр)исполкоме. Эти органы выносили соответствующие постановления. Губернские адмотделы подчеркивали неготовность местных органов милиции взять на себя дело этапирования ссыльных. Поэтому приговоренные к ссылке по этапу направлялись в район поселения одним конвоем с заключенными. В случае ссылки неэтапным порядком репрессированный освобождался из-под стражи под подписку с обязательством прибыть в назначенное место к определенному сроку. Его могли сопровождать сотрудники ГПУОГПУ или милиции. Граждане, сосланные в Сибирь из европейской части страны, этапировались по железной дороге через пересыльные пункты в Перми, Свердловске, Тюмени, Омске, Новосибирске, Красноярске и Иркутске, где они задерживались на время смены конвоя. Функции пересыльных пунктов исполняли ИТД и изоляторы временного содержания. Граждане, сосланные в Нарымский, Туруханский и Приангарский края, должны были проделывать часть пути к месту назначения по Оби, Енисею и Ангаре в трюмах пароходов. Во время прохождения этапов и заключения в ИТД и изоляторах ссыльные находились на одном довольствии с прочими арестантами. Затраты администрации мест заключения на содержание ссыльных по линии ОГПУ компенсировались из сметы этого ведомства.

К середине 1920-х гг. увеличение численности ссыльных в Сибири привело к обострению проблем, связанных с этапированием репрессированных. Наблюдатели от прокуратуры отмечали плохую организацию доставки ссыльных. Особенно тяжелая ситуация сложилась в Красноярске, где значительные группы ссыльных скапливались в изоляторе в ожидании начала навигации и отправки в Туруханский край. Окружной прокурор находил, что приток административно-ссыльных порождает ряд конфликтов, связанных с движением этапа и материальным обеспечением ссыльных в пути. Отдел ОГПУ не справлялся с отправкой репрессированных из изолятора по местам ссылки «за отсутствием средств на конвоирование»[761]. 13 марта 1926 г. вопрос об организации ссылки рассматривался на заседании Красноярского окружкома ВКП(б). Было решено усилить надзор за местами заключения и особенно за регулированием движения административно-ссыльных[762].