Этот план не был претворён в жизнь ни тогда, ни позже. Оригинального в нём мало: он очень похож на Статьи Конфедерации Новой Англии (1643), а на него, в свою очередь, похож «План Олбани» Б. Франклина (1754). Примечательно, пожалуй, только убеждение Пенна, заметное в пункте 6, что любые несправедливости в раскладе повинностей, несомых колониями, объясняются недостаточной осведомлённостью чиновников, принимающих решения, о том, какая колония какими располагает ресурсами…

19.12.1698 Пенн представил Совету по торговле мемуар, где защищал действия Пенсильвании по отношению к Навигационному акту и нелегальной торговле. Пенн выразил Совету своё недоумение: почему квакерам не позволяется давать обещание вместо присяги478. Тем не менее Пенн, как от него и требовала английская администрация, наложил вето на пенсильванский «Акт о предотвращении мошенничества и регулировании злоупотреблений в торговле» («An Act for Preventing Frauds & Regulating Abuses in Trade, 1698»).

В 1699 г. Совет по торговле решил положить конец непокорности квакерской колонии. Пенн был вызван на его заседание и согласился немедленно ехать в Пенсильванию. Он обещал сместить Маркхэма с должности заместителя губернатора, исполнять законы Англии, особенно против пиратства и незаконной торговли, и сотрудничать с колониальной администрацией и в особенности с судами адмиралтейства. 18.05.1699 Роберт Квари представил Совету по торговле обширный доклад с критикой пенсильванской практики ведения нелегальной торговли. 31.08.1699 Совет по торговле аннулировал пенсильванский «Act for Preventing Frauds», на который Пенн ранее наложил вето.

Пока Пенн оставался в Англии, он значительное время и внимание уделял делам английских квакеров. Зимой 1694/1695 г. Пенн совершил, взяв с собой сына Спрингетта, длительное путешествие по западной Англии, проповедуя на квакерских собраниях. Сопровождавший его лондонский квакер Генри Гулдни (Gouldney) – один из очень немногих, кого впоследствии Пенн пригласил на свою свадьбу – свидетельствовал, что Пенна «ещё никогда не принимали лучше». Он оказался гораздо популярнее, чем думал, среди квакеров со стажем и положением. Зимой 1695/1696 г. Пенн вновь отправился в западную Англию для проповедей на квакерских собраниях.

В 1697–1699 гг., однако, над квакерами вновь начала собираться гроза. Связано это было с некоторым ослаблением влияния вигов и усилением тори. В 1697 г. парламент начал обсуждать «Билль против богохульства» («Blasphemy Bill»). Речь шла о наказании для всех, кто отрицает Троицу – на том основании, что такое отрицание подходит под определение богохульства (blasphemy).