Летопись сообщает: «12 мая (1907 года). Начальствующий в скиту иеромонах отец Варсонофий выехал в Калугу, где имеет быть посвящен в сан игумена, коим награжден 6-го сего мая». «15 мая. Отец игумен Варсонофий, посвященный 14-го сего мая в сан игумена и награжденный палицею, сегодня возвратился из Калуги». «29 июня. Сегодня в трапезе был прочитан указ о назначении отца игумена Варсонофия скитоначальником вместо отца Иосифа, увольняемого по болезненному состоянию»426.

У отца Варсонофия были два келейника, старший — рясофорный монах Никита (Харьков)427, младший — послушник Никита Баркалов428. Письмоводителем был только что переведенный в скит из монастыря послушник Кирилл Зленко429. Трудно установить с точностью — с какого времени отец Варсонофий начал старчествовать. В 1907 году он уже широко известен как прозорливый старец, мудрый наставник в духовной жизни. Он не только братский духовник, но и окормитель множества монахинь из традиционно относившихся к оптинским старцам монастырей и общин, часто ими же и образованных. В большом количестве начали приходить и миряне. О нем прослышали и образованные люди, особенно молодые студенты, курсистки, журналисты, художники, потянулись к нему, так как он мог говорить на их языке, имел разнообразные знания, он мог открыть им корни неверия и лжи в современной культуре, хитро прикрытые внешним блеском.

Не обходили его вниманием приезжавшие в Оптину епископы. О его отношениях с владыкой Трифоном мы уже говорили. 17 мая приехал преосвященный Палладий, епископ Вольский, викарий Саратовской епархии. В скиту осмотрел храмы, навестил отца Иосифа, потом пил чай с отцом Варсонофием в его келии и долго беседовал с ним. 24 июня посетил скит Костромской преосвященный Тихон, он пришел из монастыря пешком. В скиту в сопровождении отца Варсонофия осмотрел все, а в Иоанно-Предтеченском храме обратил внимание на искусность новой отделки, особенно на потолок в приделе преподобного Макария, покрашенный в глубокий синий цвет и украшенный золотыми звездами. При этом он сказал, что храму, как земному небу, прилично иметь подобие неба, усеянного звездами… Он также навестил отца Варсонофия в его келии и беседовал с ним не торопясь, — так почти всегда бывало, что и владыкам не хотелось покидать полюбившегося им молитвенного места, вот они, сколько могли, и задерживались.

Отделка храма Иоанна Предтечи закончилась 16 августа 1907 года. Отец Варсонофий совершил в этот день молебен и окропил святой водой оба придела. Окроплены были и обновленные скитские врата. В Предтеченском храме промыта была многолетняя копоть, покрашены стены и пол, возобновлена живопись. Снаружи, по сторонам входа в храм, были написаны фигуры Архангелов Михаила и Гавриила.