Последняя фраза пророчества звучит как םישדק שדק חשמל «помазать святая святых». Это указание является последним инфинитивом, содержащимся в Дан 9, 24, и как бы подводит итог всему периоду 70 седмин. Многие иудейские и особенно христианские комментаторы усматривали здесь указание на пришествие Мессии. Тем не менее эта точка зрения не разделяется большинством современных исследователей по той причине, что выражение «святая святых» в Священном Писании никогда не используется по отношению к лицам. Специальным значением термина «святая святых» является указание на часть Скинии Собрания и Храма, где хранился ковчег Завета. Это помещение Святилища обладало особой святостью – заходить в него один раз в году мог только первосвященник, совершавший там очистительный ритуал в Йом Кипур. Кроме того, выражение «святая святых» может использоваться применительно к священным предметам, использующимся для служения в Храме: жертвеннику, сосудам, самим жертвам. Упоминание о будущем помазании Святая Святых восходит к книге Исход, где описывает обряд, проведенный Моисеем после построения Скинии Собрания (Исх 30, 22–33; 40, 9–15). Согласно этому описанию, Скиния, все ее содержимое и поставленные для служения в ней священники – Аарон и его сыновья – помазываются специально приготовленным священным маслом, запретным для употребления в профанных целях. Это описание, вероятно, восходит к реальной культовой практике допленной эпохи. Судя по всему, обряд помазания не проводился при освящении Второго Храма и при его повторном освящении после освобождения Иерусалима Иудой Маккавеем. По мысли автора книги Даниила, превращение Второго Храма в идеальный эсхатологический Храм, которое должно наступить после гибели Антиоха и окончания 70 седмин, должно включать в себя возрождение древнего обряда помазания. Именно так этот пассаж трактует большинство современных комментаторов.

Тем не менее мысль автора книги Даниила здесь более глубока и не ограничивается культовыми проблемами. Мы видим, что в стихах Дан 9, 25–26 дважды фигурирует слово Помазанник (חישמ), в обоих случаях обозначая первосвященников иерусалимского Храма. Использование однокоренных слов в Дан 9, 24 и Дан 9, 25–26 несомненно указывает на связь помазания двух первых Помазанников и эсхатологического помазания «Святая Святых», которое состоится после завершения 70 седмин. Судя по всему, автор книги Даниила в первую очередь говорит здесь о помазании священников, которое является составной частью обряда помазания, описанного в книге Исхода. Заново освященный Храм должен получить новое священство, свободное от грехов, совершенных первосвященниками-эллинизаторами.