В это время Россия постепенно утрачивала миролюбивый характер внешней политики, нарастала острота в международных отношениях. Сдача Мальты генералу Бонапарту обеспокоила Павла I, потеря острова – это удар и по Мальтийскому великому магистерству, Великий магистр Гомпеш удалился в Триест. Русское великое приорство и мальтийские кавалеры издали протестующий манифест, лишили Гомпеша гроссмейстерского звания, а 10 сентября 1798 года Павел I в декларации объявил, что он принимает орден святого Иоанна Иерусалимского под свое покровительство.

29 сентября того же года императорский двор переехал из Гатчины в Петербург. 3 октября был бал в Зимнем дворце, Анна Петровна Лопухина ужинала при дворе, а в камер-фурьерском журнале зафиксировано, что император и великие князья «за стол садиться не изволили, а в продолжение сего времени проводить изволили обозреванием заседающих при столе персон».

Под давлением европейской коалиции Павел распорядился, чтобы давно сформированый корпус Розенберга в середине октября 1798 года форсировал Буг, прошел Люблин, Краков, Брюнн, подошел к Кремсу. Так началась подготовка к сражениям в Италии и в Альпах.

29 ноября 1798 года император Павел I стал Великим магистром державного ордена святого Иоанна Иерусалимского, депутация капитула ордена в Зимнем дворце поднесла императору корону и великомагистерские регалии. 15 декабря Сенат принял решение включить титул Великого магистра в императорский титул.

23 декабря, к удивлению всей Европы, Россия заключила союзный и оборонительный договор с Оттоманской Портой. Так что и Турция вошла в коалицию против республиканской Франции.

4 февраля 1799 года Павел I писал Суворову: «Сейчас получил я, граф Александр Васильевич, известие о настоятельном желании венского двора, чтобы вы предводительствовали армиями его в Италии, куда и мои корпусы Розенберга и Германа идут. Итак, посему и при теперешних обстоятельствах долгом почитаю не от своего только лица, но и от лица других предложить вам взять дело и команду на себя и прибыть сюда для отъезда в Вену».

6 февраля флигель-адъютант Толбухин прибыл в село Кончанское и вручил повеление императора фельдмаршалу Суворову. 9 февраля Суворов прибыл в Петербург, был встречен восторженно и обласкан императором и награжден: стоя на коленях, он получил из рук императора большой крест ордена святого Иоанна Иерусалимского, а через две недели отбыл в Вену. Военные подвиги армий Суворова многократно описаны, как и поведение австрийских властей, которые оставили армии Суворова без довольствия. Летом 1799 года граф Ростопчин, возглавивший Иностранную коллегию, писал русскому послу в Лондоне графу С.Р. Воронцову: «Венский двор очень худо соответствует чистоте помыслов нашего государя. Зависть, вероломство и двуличие руководят каждыми, даже малейшими действиями этого великого барона Тугута. Боже мой! Где находят они времени на изобретение стольких хитростей и каверз? По счастию, граф Суворов не обращает внимания на интриги…»