В 1246 году крымские караимы частично переселились в Галицию, а в 1397–1398 годах часть воинов-караимов (383 семьи) попала в Литву. С тех пор, кроме исторической родины, караимы постоянно живут в Галиции и Литве. В местах проживания караимы пользовались добрым отношением окружающих властей, сохраняли национальную самобытность, имели определенные льготы и преимущества.

В начале XV века князь Элиазар добровольно подчинился крымскому хану. В благодарность хан дал караимам автономию в религиозных делах.

Караимы жили в Крыму, особо не выделяясь среди местных жителей. Они составляли большую часть населения пещерного города Чуфут-Кале, заселяли кварталы в Старом Крыме, Гезлеве (Евпатории), Кафе (Феодосии).

Присоединение Крыма к России стало звездным часом для этого народа. Караимы были освобождены от многих налогов, им разрешалось приобретать землю, что было очень выгодным, когда многие земли оказались пустыми после выселения греков, армян и эмиграции многих татар. Караимы были освобождены от рекрутской повинности, хотя их добровольное поступление на военную службу приветствовалось. Многие караимы действительно выбирали военные профессии. Немало из них отличились в боях при защите Отечества. Среди них, например, герои русско-японской войны поручик М. Тапсашар, генерал Я. Кефели. В Первой мировой войне участвовало 500 кадровых офицеров и 200 добровольцев караимского происхождения. Многие стали Георгиевскими кавалерами, а некий Гаммал, храбрый рядовой солдат, произведенный на поле боя в офицеры, заслужил полный комплект солдатских Георгиевских крестов и вместе с тем также офицерский Георгий.

Маленький караимский народ стал одним из самых образованных и богатых народов Российской империи. Караимы почти монополизировали торговлю табаком в стране. К 1913 году среди караимов имелось 11 миллионеров. Караимы переживали демографический взрыв. К 1914 году их численность достигла 16 тыс., из них 8 тыс. проживали в Крыму (в конце XVIII века их было около 2 тыс.). Показателем как богатства общины, так и расселения караимов по землям Российской империи стало строительство кенас (караимских храмов) в Харькове, Киеве, Бердянске.

Процветание кончилось в 1914 году. Войны и революция привели к потере караимами прежнего экономического положения. Вообще, караимы в массе не приняли революцию. Большинство офицеров и 18 генералов из числа караимов сражались в белой армии. Соломон Крым был министром финансов в правительстве Врангеля.

В результате войн, голода, эмиграции и репрессий резко сократилась караимов численность прежде всего за счет военной и гражданской элиты. В 1926 году в Крыму оставались 4213 караимов.