Как администратор Шамиль был одной из гениальнейших личностей XIX века. И действительно, ввести законность и порядок там, где искони царило лишь кулачное право, заставить уважать и подчиняться своим словам и приказаниям мог только человек, выдававшийся из ряда, и человек с огромной силой воли и энергией, а таковым и был Шамиль. Он разделил весь Дагестан на наибства и во главе каждого поставил верного, испытанного человека; малейшее отступление от законности жестоко наказывалось, хотя бы провинившийся был ближайшим другом имама.

Одной из лучших его мер было урегулирование дел о кровомщении. Совершенно уничтожить кровомщение ему не удалось, да он и не хотел, ибо с принципом «око за око» был вполне согласен, но он приложил все меры к тому, чтобы большинство распрей кончалось примирением, чего и добился благодаря тому, что горцы под влиянием газавата стали более единодушны и ради народного дела забыли свои мелкие ссоры. Отчасти кровомщение сократилось еще оттого, что при Шамиле убийца не мог безнаказанно скрыться, так как имам завел нечто вроде паспортов, которые должны были быть предъявляемы в каждом ауле, куда приезжал горец.

Для возвышения своего авторитета в глазах горцев Шамиль во всем, даже в мелочах, старался поступать так, как поступал пророк Магомет. В подражание последнему он переселился из Гимр в Ашильту и назвал это бегством (хиджра), а сопутствовавших ему наградил званием мугаджиров, и им было обещано вечное блаженство в будущей жизни. По примеру Магомета Шамиль назвал жителей Ашильты и всех, которые его принимали, ансарами, то есть помощниками, сподвижниками. Своим близким сподвижникам он еще давал название асхаб, а всех прочих называл общим именем мюридов.

Не только всем приближенным, но и отступникам, которые возвращались к нему, он давал всевозможные преимущества и не жалел обещаний относительно загробной жизни.

Все эти подразделения, а также установленный этикет и богослужебный ритуал сильно действовали на воображение наивных горцев, а справедливость и аскетическая жизнь имама и его глубокая ученость заставили дагестанцев действительно видеть в нем прямого наследника пророка, и потому каждое его слово считалось непреложным законом, переданным Аллахом народу через посредство имама.

Когда Шамиль сделался особенно сильным и могущественным вождем, он прибавил к своему званию еще более пышный титул амируль-муминина, то есть повелителя правоверных.

Приводя в должный порядок гражданскую и духовную часть, Шамиль деятельно организовал и часть военную. Все свои войска он разделил на полки (альф), каждый по тысяче человек, полк делился на два батальона (хамса-миа), батальон – на пять рот или эскадронов (миа), рота – на два взвода (хамсин) и каждый взвод – на пять капральств (амара). Начальники всех этих частей имели особые знаки отличия, состоявшие из небольших серебряных пластинок разной формы с гравированными на них изречениями из Корана. В первое время Шамиль страдал отсутствием орудий, но со временем этот пробел был заполнен: частью захваченными русскими пушками, а частью теми, которые были отлиты в ауле Ведено, сделавшемся первой столицей имама.