По всей видимости, Эйзенхауэр не был в курсе конкретных планов убийства Кастро. Вряд ли бывший военачальник опускался до обсуждения подобных деталей. Он считал, что достаточно дать общие указания, а подробностями должны заниматься Даллес и его люди. Представляется в то же время, что в какой-то мере эти планы не были реализованы в результате позиции президента, тормозившего их осуществление до тех пор, пока не будет создано надёжное правительство в изгнании, равноудалённое как от Кастро, так и от Батисты. Эйзенхауэр явно опасался, что в случае исчезновения Фиделя к власти на Кубе придут ещё бо́льшие радикалы вроде Рауля Кастро или Эрнесто Гевары, что создаст для США более серьёзные трудности.
В середине марта президент принял Даллеса и заместителя директора ЦРУ Ричарда Биссела, которому было поручено непосредственно руководить «кубинской программой». При этом Даллес покровительствовал Бисселу, считая его своим наиболее вероятным преемником в случае отставки. Сам же Биссел полагал, что успех операции против режима Кастро значительно повысит его авторитет и доверие к нему со стороны высших руководителей страны. Даллесом и Бисселом был представлен план, предусматривавший создание «ответственного и единого» правительства в изгнании, «пропагандистское наступление», тайный сбор информации и «тайные акции» на Кубе (по-видимому, этот пункт предусматривал террористические акции), создание на Кубе «формирования для будущих партизанских действий». Одобрив план, Эйзенхауэр подчеркнул, что опираться необходимо прежде всего на «первый пункт», для чего следует найти такого кубинца, который смог бы руководить тайными агентами, полувоенными формированиями и в то же время пользоваться авторитетом среди эмигрантов510.
Президент Кеннеди и дальнейшая подготовка операции
Прямые действия против Кубы так и не были предприняты до окончания правления Эйзенхауэра, срок которого истёк 20 января 1961 года, когда прошла инаугурация нового президента США Джона Кеннеди, представлявшего Демократическую партию.
При новом президенте положение Даллеса в качестве руководителя ЦРУ стало менее стабильным уже в силу того, что он являлся активным сторонником Республиканской партии и считал демократов слишком левыми, чрезмерно активными адептами укрепления государства и его социальных программ, нарушавших функционирование общества свободного предпринимательства. Такая оценка не соответствовала реалиям. В обеих крупных партиях были различные течения, шла борьба между явными консерваторами и явными либералами, которая особенно обострялась на первых этапах президентских предвыборных кампаний (до национальных съездов, определявших кандидатов в президенты, после чего происходило по крайней мере внешнее партийное сплочение вокруг номинанта). Избранные же президенты стремились подать себя не столько представителями своих партий, сколько выражавшими волю народа. Тем не менее определённые партийные пристрастия сохранялись как со стороны президентов, так и членов партии, потерпевшей поражение, которые оставались в госаппарате.